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一代测序技术主要是指Sanger测序法,也称双脱氧链末端终止法。以下是关于一代测序的详细介绍:
原理
Sanger测序法基于DNA聚合酶合成反应。其核心是利用双脱氧三磷酸核苷(ddNTP)作为链终止剂。在反应体系中,当DNA聚合酶在模板上合成新的DNA链时,加入带有荧光标记的ddNTP。由于ddNTP缺少3'-OH基团,无法形成磷酸二酯键,导致DNA链延伸中断。通过凝胶电泳分离不同长度的DNA片段,并根据荧光信号确定碱基顺序。
特点
- 优点:准确性高,测序读长可达1000bp,结果直观可视,适合低通量样本研究。在检测800bp以内DNA序列上的碱基变异时,精度极高。
· 缺点:测序通量低,一次只能测一条序列,大量测序成本高。难以检出高GC和重复序列区域,也不能检出大片段缺失和拷贝数变异。
应用
- 科研领域:用于基因克隆、基因突变检测(SNP)、基因组组装完整性验证等。在人类基因组计划中,Sanger测序是主要技术手段。
· 临床医学:用于肿瘤突变基因检测、单基因遗传病检测、微生物鉴定、HLA分型等。此外,还用于验证二代测序结果。
一代测序技术因其高准确性和可靠性,至今仍被视为测序领域的“金标准”。
样本类型: 血液(全血)或者组织,细胞等。
样本抽提方式: 基因组抽提DNA;
流程: 抽提DNA; 设计PCR 引物;PCR 反应;测序;