BioTNT 甲基化检测技术服务
DNA突变会导致表型改变。然而,序列不变化,基因调控照样能发生,这就是表观遗传学的威力。DNA甲基化是表观遗传学中的重要组成部分,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育中起着重要作用,也与多种癌症密切相关。
脊椎动物的DNA甲基化通常发生在CpG岛中的胞嘧啶。CpG岛是CpG二核苷富集区域,GC含量大于50%,长约200-500 bp。甲基化是由DNA甲基转移酶所催化的,将胞嘧啶转变为5-甲基胞嘧啶(5mC)。这样一个简单的生化反应却有着意想不到的严重后果。许多重要的过程如胚胎发育和细胞周期调控都与甲基化息息相关,而多个癌症也表现出异常的甲基化模式。甲基化的存在就像一个开关,在不需要基因表达的时候将基因的活性关闭;去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。
5-羟甲基胞嘧啶5-hydroxymethylcytosine(5-hmc)的分子式是C5H7N3O2,是5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)的羟基化形式,5-羟甲基胞嘧啶是TET家族的酶通过氧化5-甲基胞嘧啶(5-mC)产生的,被称为“第六种碱基”,可以调控基因表达的关闭,是一种重要的表观遗传修饰,可能与去甲基化过程有关,5-羟甲基胞嘧啶的具体作用机制还不明确。
甲基化是蛋白质和核酸的一种重要的修饰,调节基因的表达和关闭,与癌症、衰老、老年痴呆等许多疾病密切相关,是表观遗传学的重要研究内容之一。 常见的甲基化修饰有DNA甲基化和组蛋白甲基化。
由于普遍认为DNA甲基化在多种疾病尤其是癌症中扮演着重要的角色,所以人们对表观遗传学研究寄予厚望,希望能从中发现新的诊断和治疗的生物标志物。
DNA甲基化研究的经典方法:亚硫酸盐处理后进行一代测序:
样本的采集和稳定,基因组DNA 纯化,亚硫酸氢盐转化及CpG位点的甲基化检测。
后期检测为: 亚硫酸盐测序;
2.1 亚硫酸盐测序:
实验步骤:
l 基因组DNA的提取;
l BSP实验亚硫酸盐处理及纯化(QIAGEN,cat:59824)
l 引物的设计(加粗斜体下划线部分为引物位置,红色字体区域为检测区域)PCR产物
l PCR扩增;反应程序
l T/A克隆与测序:PCR产物纯化,连接T载体,转化酶切法鉴定阳性菌落,挑取质粒送测序(10个克隆);
l 实验结果:
1. DNA 质量鉴定,Nano 数据,
2. DNA 完整性电泳图片;

3.PCR 产物电泳图片;
.png)
4.测序分析结果:


