硫代修饰：
可以增强探针的稳定性，抵抗核酸酶的降解，同时可能改变探针的一些物理化学性质，有助于其在生物体内的应用，如在原位杂交等实验中提高探针的耐受性。

（脱氧次黄嘌呤）dI 修饰：
dI 可与多种碱基配对，能增加探针的碱基配对灵活性和特异性，常用于一些需要特殊碱基配对模式的核酸检测或基因编辑等实验中，可改善探针与靶序列的结合能力。

（脱氧尿嘧啶）dU 修饰：
在某些核酸扩增反应中，如 PCR，dU 修饰的探针可用于区分新合成的 DNA 链和原始模板链，还可用于引入特定的标记或进行后续的酶切等操作。此外，在 RNA 干扰实验中，dU 修饰的寡核苷酸可以作为一种稳定且有效的干扰分子。

5 - Methyl dC 修饰：
这种修饰可以影响 DNA 的甲基化状态，进而影响基因的表达调控。在表观遗传学研究中，5 - Methyl dC 修饰的探针可用于检测特定基因区域的甲基化水平，帮助了解基因表达的调控机制以及与疾病发生发展的关系。

2' - O - Me - C 修饰、2' - O - Me - G 修饰、2' - O - Me - U 修饰、2' - O - Me - A 修饰：
这些 2'-O-Me 修饰可以增强核酸探针的稳定性，提高其对核酸酶的抗性，同时还能改善探针与靶标 RNA 的结合亲和力和特异性。常用于反义核酸技术、RNA 干扰等领域，用于抑制特定基因的表达或研究基因功能。

5 - Carboxy - dC 修饰、5 - Hydroxymethyl - dC 修饰、5 - Formyl - dC 修饰：
这些修饰的探针可用于检测 DNA 的氧化损伤或特定的表观遗传标记。例如，5 - Hydroxymethyl - dC 是一种重要的表观遗传修饰，其修饰的探针可用于研究 DNA 羟甲基化在发育、疾病等过程中的作用。此外，这些修饰也可用于标记 DNA，以便进行后续的分离、检测等操作。

N6 - Me - dA 修饰：
主要与 DNA 的甲基化调控有关，可影响基因的表达和染色质的结构。在研究基因表达调控、细胞分化以及疾病发生机制等方面，N6 - Me - dA 修饰的探针可用于检测特定基因区域的这种甲基化修饰，有助于揭示相关的分子机制。

2’-F - 碱基修饰：
2’-F 修饰可以增强核酸的稳定性，提高其对核酸酶的抵抗能力，同时还能改变核酸的构象和热力学性质，使探针与靶标核酸的结合更加稳定和特异。常用于核酸药物研发、基因检测等领域，可提高核酸药物的疗效和基因检测的准确性。