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技术宝典— qPCR
PCR Array 篇(2)----PCR Array 与基因表达谱芯片、Real Time PCR 的特点比较

 

PCR Array

RealTime PCR

基因表达谱芯片

蛋白芯片

定义

功能分类芯片或PCR 列阵,它结合了实时定量PCR技术灵敏可靠的优势以及微列 阵技术同时检测多种基因表达量的优势,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

Real-Time PCR 技术,又称实时定量荧光PCR,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号累积实时监测整个PCR进程,后通过标准曲线对未知模板进行总量分析或通过Ct值对模板进行相对定量。模板进行定量分析。

基因芯片是一种新型杂交和测序方法以对大量的遗传信息进行高效、快速的检测、分析

基因表达谱指通过构建处于某一特定状态下的细胞或组织的非偏性cDNA文库,大规模cDNA测序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群体组成,从而描绘该特定细胞或组织在特定状态下的基因表达种类和丰度信息。

蛋白芯片是一种高通量监测系统,通过靶分子和捕捉分子相互作用来监测蛋白分子之间的相互作用。

研究对象

RNAcDNA、基因组DNA

RNAcDNA、基因组DNA

RNAcDNA、基因组DNA

蛋白质

实验性质

定量

定量

定性、半定量(需其他方法再验证)

定性、半定量、定量(需其他方法再验证)

主要适用范围

基因功能分类、生物学通路研究、相关基因表达量

转录水平表达量,以及基因表达定性检测

监测大范围基因的表达水平,筛选靶基因

检测大范围蛋白的表达水平,筛选靶蛋白

次要适用范围

------

基因突变,修饰,分型的检测

转录水平表达量,以及基因表达定性检测

小范围靶蛋白含量检测。

假阳性率

中等

数据通量

80-160个基因,高通量

<20个基因,低通量

>10000个基因,超高通量

10-1000个蛋白,高通量

样本数量

灵敏度

中等

重复性

中等

中等

适用性

方便,普通qPCR仪就能检测分析

方便,普通qPCR仪就能检测分析

困难,特定的基因芯片仪器以及专业的仪器适用人员

困难,特定的蛋白芯片仪器以及专业的仪器适用人员

实验周期

2

1

1个月

1个月

分辨率

中等

中等

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