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技术宝典— Western Blotting
BioTNT Western Blotting 02 ------ 样本制备及注意事项


一、Western 实验中细胞的采集、处理和保存

 

1、贴壁细胞,加1ml PBS清洗,弃上清,加RIPA(六孔板200ul,培养瓶400ul)冰上消化半小时,细胞刮板,将RIPA转移至EP管,用枪吹打细胞RIPA200次;

2、细胞团块,加1ml PBS重悬细胞,分装至EP管,1000rpm离心5分钟,弃上清,加50ul RIPA冰上消化半小时,用枪吹打细胞RIPA200次;

3、悬浮细胞或细胞冻存液细胞,转移至EP管,1000rpm离心5分钟,弃上清,加1ml PBS重悬细胞,分装至EP管,1000rpm离心5分钟,弃上清,加50ul RIPA冰上消化半小时,用枪吹打细胞RIPA200次;

4、保存

  上述步骤处理完后,将细胞放入冰箱冻存(尽量避免反复冻融,否则会使样本蛋白降解)

  -20下,可放置保存1个月;

  -80℃下,可放置保存6个月;

 

 

二、Western 实验中易碎组织(脑、肝、肾)的采集、处理和保存

 

1、样品大小50-100mg,按质量体积比1:5加入RIPA

2、冰水浴中用眼科剪剪碎组织块;

3、冰水浴中电动匀浆机(每个样本20-30s)或超声破碎;

4、保存

  上述步骤处理完后,将细胞放入冰箱冻存(尽量避免反复冻融,否则会使样本蛋白降解)

  -20下,可放置保存1个月;

  -80℃下,可放置保存6个月;

 

 

三、Western 实验中不易碎组织如(心肌、肌肉组织)的采集、处理和保存

 

1、样品大小50-100mg,按质量体积比1:5加入RIPA

2、冰水浴中用眼科剪剪碎组织块;

3、冰水浴中研磨棒研磨或超声破碎;

4、保存(尽量避免反复冻融,否则会使样本蛋白降解)

  -20下,可放置保存1个月;

  -80℃下,可放置保存6个月;

备注:心肌、肌肉组织无法用匀浆机匀浆,组织块会绞入钻头形成团块,无法被匀浆机刀头切碎,需用研磨或超声才能充分破碎。

 

 

四、Western 实验中上皮组织(皮肤、膀胱、肠)的采集、处理和保存

 

1、样品大小50-100mg,按质量体积比1:5加入RIPA

2、冰水浴中用眼科剪剪碎组织块;

3、冰水浴中研磨棒研磨或超声破碎;

4、保存(尽量避免反复冻融,否则会使样本蛋白降解)

  -20下,可放置保存1个月;

  -80℃下,可放置保存6个月

备注:上皮组织韧性较强,较难剪碎,需要增加组织破碎时间才能充分破碎。

 

 

五、Western 实验中小颗粒组织(如:神经节、小鼠眼角膜、巩膜、韧带)的采集、处理和保存

 

1、按样本大小加入适量的RIPA

2、冰水浴中用显微剪剪碎组织块;

3、冰水浴中研磨棒研磨或超声破碎;

4、保存(尽量避免反复冻融,否则会使样本蛋白降解)

  -20下,可放置保存1个月;

  -80℃下,可放置保存6个月

 

备注:小颗粒组织量比较小,会有蛋白浓度量低于检测限度的风险,且样本量太少,无法被匀浆机刀头切碎,需用研磨或超声才能充分破碎;研磨时应格外细心。

 

 

六、Western 实验中骨头组织的采集、处理和保存

 

 1、用已消毒过的咬骨钳将骨组织咬碎

 2、加入适量RIPA,放入冰箱,浸泡半天,使骨头软化

 3、冰水浴中用眼科剪剪碎组织块

 4、冰水浴中电动匀浆机(每个样本20-30s)或超声破碎;

 5、保存

  上述步骤处理完后,将细胞放入冰箱冻存(尽量避免反复冻融,否则会使蛋白降解)

  -20下,可放置保存1个月;

  -80℃下,可放置保存6个月

 

 

七、Western实验中全血的采集、处理和保存

 

  1、采集血样,室温保存。使用一次性的抗凝的真空抽血管进行采血。一般使用EDTA或肝素抗凝均可;血量一般为1ml

  2、从全血中提取淋巴细胞后,加入100-200ulRIPA裂解淋巴细胞;(全血提取淋巴细胞见附录)

  3、超声破碎或用枪吹打200下;

  4、保存;

     将细胞放入冰箱冻存(尽量避免反复冻融,否则会使蛋白降解)

    -20下,可放置保存1个月;

    -80℃下,可放置保存6个月;

备注:全血千万不能放入干冰中送样,应室温保存

 

 

附录I:抗凝剂

 

抗凝是用物理或化学方法除去或抑制血液中的某些凝血因子的活性,以阻止血液凝固。能够阻止血液凝固的物质,称为抗凝剂或抗凝物质。常用抗凝剂和使用方法如下。

 

1、乙二胺四乙酸(EDTA)盐常用有钠盐或钾盐,能与血液中钙离子结合成螯合物,使Ca2+失去凝血作用,阻止血液凝固。根据国际血液学标准化委员会(ICSH)建议,CBC抗凝剂用量为EDTA-K.2H2O1.52.2mg/ml血液。不适于凝血检查、血小板功能试验。

 

2、草酸盐常用有草酸钠、草酸钾、草酸铵,溶解后解离的草酸根离子能与样本中钙离子形成草酸钙沉淀,使Ca2+失去凝血作用,阻止血液凝固。2mg草酸盐可抗凝lml血液。但不适于凝血检查。而且,草酸盐浓度过高还会导致溶血、改变血液pH,干扰血浆钾、钠、氯和某些酶活性的测定。

双草酸盐抗凝剂:适用于血细胞比容、CBC、网织红细胞计数等检查,不适于血小板计数、白细胞分类计数。

 

3、肝素是加强抗凝血酶Ⅲ(AT-Ⅲ)灭活丝氨酸蛋白酶作用,阻止凝血酶的形成,并阻止血小板聚集等作用,从而阻止血液凝固。肝素是红细胞透渗脆性试验的理想抗凝剂。但不适于CBC、细胞形态学检查。每毫升血液肝素用量为(15±2.5U,多为肝素钠盐或钾盐。

4、枸橼酸盐常用有枸橼酸钠,能与血液中钙离子结合形成螯合物,阻止血液凝固。枸橼酸盐抗凝剂的抗凝力不如上述抗凝剂。枸橼酸钠与血液的抗凝比例为1914.适用于红细胞沉降率、凝血检查,是输血保养液的成分。

 

 

附录II:裂解液

 

裂解液

作用

风险

去离子水或双蒸水

无外源离子或其他杂质干扰

会产生渗透压,提前导致内源性酶及蛋白释放,蛋白易降解

0.9% NaCl

无其他杂质干扰,不会产生渗透压问题

非缓冲液体系,遇不同pH的样本无法调节

0.01M PBS1×)(pH 7.4)

缓冲液体系,简单常用裂解液

遇到定磷法检测ATP之类的实验无法使用,会干扰结果

20mM Tris-HCl (pH 7.5)

缓冲液体系,简单常用裂解液

配置的原料Tris碱有轻微毒性和刺激性

1% TritonX-100(添加剂)

能溶解脂质,以增加抗体对细胞膜的通透性

 

β-巯基乙醇(添加剂)

还原剂,保护蛋白质中自由的半胱氨酸巯基

危险品!经皮肤、吞咽吸收有致命危险

 

 

附录III:蛋白酶抑制剂

 

PMSF

特性:丝氨酸蛋白酶抑制剂,如胰凝乳蛋白酶,胰蛋白酶和凝血酶,也抑制半胱氨酸蛋白酶如木瓜蛋白酶(可逆的地面处理)。

溶解性:溶于异丙醇,乙醇,甲醇和丙二醇果>10mg/ml。在水溶液中不稳定。在100%异丙醇, +25℃时稳定至少9个月

分子量:174.2

使用:贮存浓度:200mM,工作浓度:1mM

 

Leupeptin 亮肽素

特性:抑制丝氨酸和半胱氨酸蛋白酶如胰蛋白酶,木瓜蛋白酶,纤溶酶,和组织蛋白酶B

溶解性:高度溶于水(1mg/ml)。4℃一周稳定,分成小份冷冻在-20℃至少6个月

分子量:C20H38N6O4 x 1/2 H2SO4:475.6

C20H38N6O4 x 1/2 H2SO4 x H2O:493.6

使用:贮存浓度:1mg/ml,工作浓度0.5 ug/ml (1mM)

 

Aprotinin抑肽酶

特性:丝氨酸蛋白酶抑制剂,抑制纤维蛋白溶酶, 激肽释放酶,胰蛋白酶,糜蛋白酶的高活性。不抑制凝血酶或因子X

溶解性:易溶于水(10mg/ml)或缓冲液(例如,tris0.1MpH8.0)。pH7-8的溶液在4℃可保存1周,分装保存在-20℃可至少保存6个月。避免反复冻融, pH>12.8的碱性环境可使其灭活。

分子量:6512

使用:贮存浓度:1mg/ml, 工作浓度:0.062.0 ug/ml(0.010.3 uM)

 

Pepstatin胃蛋白酶抑制剂

特性:抑制天冬氨酸(酸)蛋白酶如胃蛋白酶,肾素,组织蛋白酶D,凝乳酶, 许多微生物酸性蛋白酶

溶解性:溶于甲醇约1mg/ml 可溶于乙醇,过夜溶解可达到1 mg/ml;在6当量乙酸中溶解度为300ug/ml4℃稳定一周,分装储存于-20℃时可保存1个月

分子量:685.9

使用:贮存浓度:1mg/ml,使用浓度:0.7 ug/ml(1 uM)

 

EDTA-Na2

特性:金属蛋白酶抑制剂

溶解性:溶于水至0.5M,在pH8-9的条件下,4℃稳定至少6个月

分子量:372.24

使用:工作浓度:0.20.5 mg/ml(0.51.3 mM),不需现用现配,在溶液pH值调至8-9时再加入。

 

NaF氟化钠

特性:磷酸酶抑制剂

溶解性:溶于水

分子量:41.99

使用: 贮存液:5M    工作浓度:10-20mM

 

Na3VO4 原矾酸钠

特性:磷酸酶抑制剂

溶解性:溶于水

分子量:183.91

如果购买过来的是原矾酸钠,需要经过处理以后才能成为激活的矾酸钠,激活的矾酸钠才具有抑制去磷酸化的作用。原矾酸钠变成激活的矾酸钠的过程是:

(1).0.183克的原矾酸钠溶解于10ml的双蒸水中,加酸调节PH10(颜色变黄)

(2).煮至无色

(3).室温冷却

(4).重调PH10

(5).重复(1)(2)(3)(4)直至溶液保持无色,并且pH稳定于10,分装100ul/管,每10ml裂解液加一管。(终浓度为1mM)-20度保存。

使用: 贮存液:100mM 工作浓度:1mM

 

 

 

 

 

 

 

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