产品参数
                                                
                                                
                                                    高通量测序(NGS)技术服务
高通量测序(NGS)可以对几百万条DNA分子进行大规模并行测序,以较低的成本快速地提供海量数据。NGS可以对某物种的转录组和基因组进行细致全貌的深度分析,帮助研究人员解决以前需要数年才能解决的问题。
BioTNT联合复旦遗传平台为客户提供全面的高通量测序解决方案。我们经验丰富的专家将为您提供全方位的项目解析及设计,并依据项目特点对文库构建、测序、生物信息学分析等服务制定标准或定制化的解决方案。此外,我们贴心的项目管理还将在您项目的每个阶段为您提供项目更新、咨询,并提供售后服务。
 
WES 全外显子测序(10G)
    定义:WES是专门针对基因组中的外显子区域进行测序的技术,外显子是编码蛋白质的DNA序列。
    特点:
        高效性:由于外显子区域仅占基因组的约1%,WES能够在较短时间内获得大量外显子区域的测序数据。
        准确性:针对外显子区域进行测序,能够更准确地检测与疾病相关的变异。
        成本效益:相对于WGS,WES的成本更低,且能够覆盖大部分已知的人类遗传疾病相关基因。
        应用:适用于遗传疾病的诊断、疾病关联基因的发现、个体化医疗等。
    - 测序范围:WGS覆盖整个基因组,包括外显子和非编码区域;而WES仅针对外显子区域进行测序。
 
    - 数据量:WGS需要大约100Gb的数据来覆盖整个基因组;而WES使用相对较少的数据量(通常几个Gb)即可达到较高的测序深度。
 
    - 测序深度:由于WES只针对外显子区域进行测序,其测序深度远高于WGS,有助于发现低频率的变异和镶嵌变异。
 
    - 成本:WGS的成本远高于WES,因为WGS需要更多的测序数据来覆盖整个基因组。
 
综上所述,WGS和WES在遗传学研究和疾病诊断中各有优势,具体选择哪种技术取决于研究或诊断的需求和预算。
测序平台:
Illumina 测序平台
华大测序平台;
 
样本处理与运输要求
    
        
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             应用项目 
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             样本类型 
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             处理要求 
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             运输要求 
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             WGS/WES等DNA项目 
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             gDNA 
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             l     DNA溶于TE buffer; 
            l     总量≥1 ug,浓度≥40 ng/uL 
             | 
            
             R干冰 
            R冰袋 
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            | 
             外周血 
             | 
            
             l     建议使用柠檬酸钠管或EDTA管,不建议肝素抗凝; 
            l     总量≥1 mL 
             | 
            
             R干冰 
            R冰袋 
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            | 
             培养细胞 
             | 
            
             l     细胞离心去除培养液,PBS洗两次,收集细胞沉淀,立即在液氮中急冻; 
            l     细胞数量≥2×106 
             | 
            
             R干冰 
             | 
        
        
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             新鲜冻存组织 
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             l     活体取材后Nuclease-free水进行漂洗,并剔除结缔组织或毛发等非研究组织;样本在冰上分割成30-50 mg的小块后,分装在预冷的EP管中,立即在液氮中急冻; 
            l     样本量≥30 mg 
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             R干冰 
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             石蜡包埋组织 
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             l     切片为白片,不进行染色、高pH、重金属离子染色等处理; 
            l     切片5-10片; 
            l     切片厚度10 μm,面积100 mm2 
             | 
            
             R冰袋 
            R常温 
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             RNAseq/小RNAseq等 
            RNA项目 
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             总RNA 
             | 
            
             l     总RNA溶解于DEPC水或Nuclease-free水; 
            l     总量≥1   ug,浓度≥40   ng/uL 
            l     OD260/280=1.8-2.1,完整性RINA≥6 
             | 
            
             R干冰 
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             外周血 
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             l     首选方案:建议使用PAXgene管; 
            l     第二方案:建议使用柠檬酸钠管或EDTA管,不建议肝素抗凝; 
            l     总量≥2 mL 
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             R干冰 
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             血浆/血清 
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             l     总量≥1 mL 
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             R干冰 
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             培养细胞 
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             l     首选方案:细胞离心去除培养液,PBS洗两次,收集细胞沉淀,立即加入TRIzol溶液,并充分吹打混匀; 
            l     第二方案:细胞离心去除培养液,PBS洗两次,收集细胞沉淀,立即在液氮中急冻; 
            l     细胞数量≥2×106 
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             R干冰 
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             新鲜冻存组织 
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             l     首选方案:活体取材后Nuclease-free水进行漂洗,并剔除结缔组织或毛发等非研究组织;样本在冰上分割成30-50 mg的小块后,保存在RNAlater溶液中。 
            l     第二方案:活体取材后Nuclease-free水进行漂洗,并剔除结缔组织或毛发等非研究组织;样本在冰上分割成30-50 mg的小块后,分装在预冷的EP管中,液体急冻; 
            l     样本量≥30 mg 
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             R干冰 
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             石蜡包埋组织 
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             l     切片为白片,不进行染色、高pH、重金属离子染色等处理; 
            l     切片5-10片; 
            l     切片厚度10 μm,面积100 mm2 
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             R冰袋 
            R常温 
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