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细胞STR鉴定:细胞身份的“指纹识别”
细胞STR鉴定是一种基于分子生物学的遗传分析技术,通过检测细胞DNA中的短串联重复序列(Short Tandem Repeats,STR),来确定细胞的真实性和遗传纯度。STR序列由短的、连续重复的核苷酸组成,不同个体在特定STR位点的重复次数不同,因此产生的扩增片段长度也不同,可作为遗传标记用于个体识别。
为什么要做细胞STR鉴定?
- 确认细胞系身份:实验室中常用的细胞系可能经过多次传代,容易出现交叉污染或错误标记的情况。通过STR鉴定,可以确认细胞系的真实性和纯度,确保实验所用的细胞与预期的细胞类型一致。
- 检测交叉污染:细胞培养过程中,不同细胞系之间可能会发生交叉污染,这会严重影响实验结果的解释。STR鉴定有助于检测和预防这种污染。
- 保障科研诚信:在发表科研论文时,编辑和同行评审者通常要求提供细胞STR鉴定数据,以验证实验材料的准确性,这是科研诚信的一部分。
- 监测遗传稳定性:随着细胞的不断传代,它们的遗传物质可能会发生突变。STR鉴定可以监测这些变化,确保细胞保持遗传稳定性。
- 支持研究的可重复性:通过STR鉴定,可以确保不同实验室使用的细胞具有相同的遗传背景,从而提高研究的可重复性。
STR鉴定的流程
- 样本收集:收集细胞样本。
- DNA提取:从细胞样本中提取DNA。
- PCR扩增:选择特定的STR位点,设计相应的引物,进行PCR扩增。
- 电泳分析:将PCR产物进行凝胶电泳,以分离不同长度的扩增片段。
- 结果解读:根据电泳图谱上的条带,确定每个STR位点的等位基因大小。
- 数据分析:将得到的STR分型与数据库中的已知样本进行比对,以确定细胞身份。
注意事项
- 灵敏度与局限性:利用STR鉴定来判断种属内细胞的交叉污染,其灵敏度约为10%。如果污染比例低于10%,通常STR鉴定结果中不会出现明显的峰值变化。
- 小鼠细胞鉴定:小鼠细胞系的基因型差异相对较小,可能会出现来自不同个体的细胞,STR鉴定位点匹配率高于80%。面对这种情况,小鼠一般不提供STR鉴定,一般是提供种属鉴定。
细胞STR鉴定是科研诚信与数据可重复性的基石,建议所有细胞实验用户将其纳入常规质控体系,为高质量科研保驾护航。