产品参数
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无内毒素质粒大量制备试剂盒
(增强离心柱型)
BK2110 2次/10次
试剂盒组成

u 自备试剂、设备及耗材等
l 无水乙醇(配漂洗液WS 用)
l 50ml 离心管若干(收菌及处理上清),建议用 KG2811
l 可使用 50ml 离心管的水平离心机,转速可达 4000rpm
l 5ml 或 10ml 移液器及枪头(全程操作以移液器取液为主)
u 实验前准备:
l 第一次使用产品前,请仔细阅读说明书。
l 检查漂洗液WS 是否按照要求加入乙醇。
l 室温较低时,请检测溶液 SⅡ中是否有沉淀。若有沉淀,请于 37℃保温溶解,待恢复到室温后使用。
l 过夜培养的状态良好的菌液。
u 菌液培养及用量:
l 质粒提取量的多少,除了质粒拷贝数的特性外,菌液培养的状态也是影响质粒提取量的重要因素。
l 使用较少的培养基和较高的转速保证培养液的通气条件,是菌液生长良好的关键因素。
l 强烈建议先取 2ml 菌液做小提质粒,检测一下质粒的含量及质量,看是否适合用于质粒大量提取。
l 做质粒的中量及大量提取时,我们建议使用 2YT 这类营养丰
注:
*平衡液CBS用于质粒提取前柱子的平衡处理,可以活化硅胶膜,有利于提高质粒的产量。
*漂洗液WS在使用前应按1:4比例加入乙醇。
u 产品特点简介:
l 吸附柱容量:1000~3000ug(不同大小质粒有差异)。
l 本试剂盒采用碱裂解法分离质粒,通过优化溶液体系,并结合膜吸附技术特异性吸附质粒,可以获得高产量、低内毒素水平的质粒,具有高效、快速、方便、经济实惠的特点。
l 一般常规试剂盒提取的质粒内毒素水平会超过 1000EU/ug。而使用本试剂盒可获得很好的满足转染等实验要求的无内 毒素质粒,如对于中高拷贝数的质粒,内毒素水平一般
<0.1EU/ug。
u 保存温度:
l RNase A:建议 2~8℃保存,长期保存可置于-20℃保存。室温(25℃)可稳定保存一个月以上。
l 大提质粒不建议将 RNase A 加入到溶液 SI 中,而是改为提取质粒时,加到溶液SIV 步骤后面,可以充分发挥 RNase A的活性,最大限度降低 RNA 对后面质粒提取的影响。
l 试剂盒其余组分于室温(15℃~25℃)可以稳定存放 1.5 年而使用活性无明显衰减。室温过高或需要更长期保存,请放置于 2~8℃。
u 运输温度:
l 室温运输。如果温度高于 30℃,请酌情放置冰袋运输。
富的培养基,可以获得较高的菌体浓度。
l 一般使用LB 培养基时,我们建议使用 100ml~200ml 菌液。使用 2YT 培养基时,最多使用不超过 100ml 菌液,或者每管收集菌体的湿菌重量不超过 1.0 克,否则会导致菌液裂解不充分而影响质粒质量及产量,降低超螺旋质粒的比例。
u 菌液暂存条件:
l 如果菌液不能立即用于质粒提取,可先将菌液放置于-20℃,快速的将菌液温度降至 0℃左右,然后转入 4℃存放。保存的菌液在两天之内用于质粒提取,不会明显影响提取的质粒质量。
u 溶液eDBS使用注意事项:
l 溶液eDBS 用于将质粒结合到柱子上,正确使用非常关键。
l 首先要准确估算上步得到的上清液体积,一般使用一个刻度比较准确的 50ml 离心管来估算体积。
l 其次,准确加入 40%体积比的eDBS,尤其要注意枪头中残留的没有加到溶液中的死体积。如有必要,将移液器调大一个刻度,将这些死体积考虑进去。
l 在实验操作步骤 10 中,按照正确的比例准确加入 eDBS 很重要。很多时候提取的质粒量与期望值相差放多,多半问题都发生在这一步。
使用水平离心机快速操作指南
以下是以常用的可以达到 4000rpm 速度的水平离心机做参考。本试剂盒配备的DNA 吸附柱 GP7 由于角度问题,需使用水平离心机操作,不适合角转子离心机。
Ø DNA 吸附柱平衡处理
1. 将吸附柱 GP7 放于 50ml 收集管中,向吸附柱中加入 4ml平衡液 CBS,将其快速离心到约 500rpm,静置 5~10min,让溶液充分浸润吸附膜。然后 4,000rpm 离心 3min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中备用。
注意事项:
l请使用当天处理过的 DNA 吸附柱。
l瞬时离心,可以使平衡液 CBS 充分浸润到吸附膜中。
Ø 菌体收集
2. 根据菌液生长的状态,使用自备 50ml 离心管,取适当量过夜培养的菌液,4000rpm 离心 10min,收集菌体,并倒尽上清。
注意事项:
l根据试剂盒首页说明收集适量菌液,用于质粒提取
l对于较低拷贝数的质粒,可以考虑平行做 2 份菌液,处理所得上清最后通过多次离心收集到一个吸附柱中,以增加产量。
Ø 菌体收集及裂解
3. 加入 12ml 溶液 SI,用振荡器充分悬浮细菌。注意事项:
l不要残留细小菌块,否则会影响裂解,导致质粒量低和质量下降。
l此步可加入 50µl Visual Blue 指示剂,用于监控后面处理是否充分。
4. 加入 12ml 溶液 SII,立即温和并充分地上下翻转混合 4-6次,使菌体充分裂解,直至形成均匀透亮的溶液,此步骤不宜超过 5min。
5. 加入 9.6ml 溶液SIV,温和并充分地上下翻转混合 8~10 次,然后向每管加入 100µl RNase A,室温放置 10min。然后 4,000rpm 离心 8min。
注意事项:
l充分中和的上清液,应生成大量的白色絮状沉淀,且没有局部粘稠物存在。
l如果在第 3 步加了 Visual Blue 指示剂,则此步溶液蓝色完全消失。
l如果RNase A 已经预先加到了溶液 SI 中,则此步无需再加 RNase A。
Ø 收集上清液并进行内毒素清除操作
6. 准备一个新的过滤器,拔掉推杆,放于 50ml 离心管口,然后小心的将第 5 步离心得到的上清液倒入过滤器,重新插入推杆,小心推动推杆,将上清液过滤到 50ml 离心管中。此步骤能够得到约 30~32ml 上清液,然后加入 3ml GTER 溶液,并颠倒混匀。然后于冰水浴中冷却 5~10min,期间可以颠倒摇匀几次,使GETR 与内毒素充分接触。冷却后的溶液变成蓝色透明状。GETR 溶液比较粘稠,注意缓慢加入以保证加入比较准确的体积。
7. 将上一步的溶液转到 42℃水浴中,放置 5min,溶液重新变浑浊,甚至蓝色有机相会部分聚集到管底。
8. 4,000rpm,室温离心 5min,溶液将分为无色的上层水相和蓝色的下层有机相。由于离心速度限制,溶液分层可能不是非常清晰。将离心管静置 5~10 分钟,溶液将分层更清晰。
9. 注意事项:
l下层溶液离心后体积会变大,属正常现象,不会造成质粒损失。
10. 将上层溶液转移到一个新的 50ml 带刻度离心管中。该步操作,可以小心的直接将上清慢慢倒入新离心管中,一般下层蓝色有机相比较粘稠,熟练操作时,一般不会随上层水相倒出来。
11. 根据离心管的刻度估算倒出来的上清液体积,准确加入 40%体积的 eDBS 缓冲液,转入到正常的质粒提取环节即可
注意事项:
l 此步准确的估计上清液体积并按照 40%比例加入溶液eDBS 很重要。 eDBS 加入不足,会严重影响质粒产量,反之,过大比例的 eDBS 会导致提取的质粒中中有较多的 RNA 干扰,造成浓度虚高。
Ø 质粒吸附、漂洗
12. 将步骤 10 得到的滤液,分多次转移至吸附柱 GP7 中进行质粒 DNA 吸附。每次吸取不超过 20ml 滤液加入吸附柱, 4,000rpm 离心 2min。多次操作,直到所有溶液都通过吸附柱 GP7。
13. 将 DNA 吸附柱重新放回收集管中,加入 10ml 溶液 eDBS,
4,000rpm,室温离心 2min,倒掉收集管中废液。
14. 将吸附柱重新放回收集管中, 加入 10ml 漂洗液 WS,
4,000rpm,室温离心 2min,倒掉收集管中废液。
15. 重复步骤 13 一次。
Ø 空甩甩干
16. 倒掉收集管中废液,4,000rpm,室温离心 5min,彻底去除漂洗液 WS(此步骤不可省略)。然后将吸附柱 GP7 放入一个新的 50ml 收集管中(试剂盒中标配的),开盖室温或 37℃放置 5min,以晾干吸附膜中残留的漂洗液 WS。
Ø 质粒洗脱
17. 在吸附柱的膜中央加入 1.5ml 洗脱缓冲液 EB,室温或者
37℃放置 5~10min,以充分浸润吸附膜。
18. 4,000rpm,室温离心 3min,离心管中的液体即为包含目的质粒的溶液。
洗脱质粒注意事项:
l质粒洗脱这一步,加入足量的洗脱缓冲液 EB 比较重要。应确保加入洗脱液后吸附膜表面呈现湿润的状态,否则需要再补加洗脱缓冲液。一般 1.2~1.5ml 洗脱缓冲液的体积是足够的。
l加入洗脱液后,放置充足的时间,是将质粒从膜上洗脱下来的关键。
l一般将第一次洗脱能够洗下来的溶液重新吸到膜上,进行第二次洗脱,可以提高 10%~20%的回收率。
l如果第一次洗脱的质粒浓度超过 1500ng/ul,有必要再洗脱一次质粒,并独立收集,通常洗脱液中还会有较高浓度质粒。
Ø 质量检测
19. 测定质粒浓度,并取 1~3µl(视质粒浓度定)进行琼脂糖凝胶电泳,检测所提质粒的质量。纯化好的 DNA 可立即用于后续实验或-20℃冻存。
注意事项:
l如需电泳检测质粒超螺旋等情况,建议质粒加样量不超过 500ng。电泳时加入过多的质粒,会跑成一片,无法评估质粒质量。