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BioTNT PCR ARRAY of Rat Telomeres & Telomerase+ …
    产品中心    >>  试剂    >>  分子生物学试剂    >>  PCR Array 关   闭
PCR ARRAY of Rat Telomeres & Telomerase+ primer
分类:PCR Array
品牌:BioTNT
货号:A2020A0154R/B
原价:7200
现价:¥5538.00    节省:¥1662
特异性种属:rat
规格:250板
产品参数

一、产品介绍:


PCR Array

 

 

BioTNT qPCR Array专为检测不同组织或细胞中特定基因的表达量而设计,这些基因按照预制或定制要求成套设置。检测结果所显示的表达差异可帮助研究者鉴定或验证这些基因的生物学意义,以及与其研究的重要相关性。

对于目录(预制)产品,每块384孔板包含84对PCR引物,可以进行4个样本单孔或者两个样本双复的实验。这些引物全部经过预先验证,并包被于指定的板孔中。在同一块96孔板上,有12个(384孔板有48个)反应孔包被了不同类型的对照,用以检测从反转录到qPCR整个过程的反应效率。

逆转录试剂和以荧光染料SYBR?Green 为基础的定量检测试剂作为被推荐的RT-qPCR试剂产品可与qPCR Array配套使用。该系列试剂均经过优化,具有高的灵敏度、效率和特异性。其他公司的类似试剂可能适用,但未验证过,不推荐使用。

 

产品优势


BioTNT QPCR芯片特点:

灵敏度高,样本使用量低

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 


产品说明


The Rat Telomeres & Telomerase RT2 Profiler? PCR Array profiles the expression of 84 key genes central to telomere replication and maintenance. Telomeres, repetitive DNA regions of hexanucleotide repeats, protect chromosomal ends from deterioration during DNA replication. Telomerase (TERT), a reverse transcriptase, forms a complex with an RNA template and cofactors to extend telomeres. The shelterin protein complex then binds the 3' single-stranded end of telomeric DNA, protecting it from DNA damage responses. Inhibition of this process leads to short telomeres and premature aging-related diseases, whereas uncontrolled telomere lengthening promotes carcinogenesis. Research into telomeres often utilizes simpler model organisms, such as yeast, meaning that many mechanistic details have yet to be discovered or confirmed in mammalian systems by you. This array contains genes involved in telomere maintenance as well as genes comprising the telomerase and shelterin complexes and their regulators. This array also includes genes recently described in telomere regulation, such as the SLX4 complex, as well as other genes associated with telomeres but with poorly understood functions. Using real-time PCR, you can easily and reliably analyze the expression of a focused panel of genes involved in telomere maintenance and genome integrity with this array.

 

 

 

二.运输和储存条件:


4度运输。

-20°C储存至少6个月;

 

 

三.适用仪器:


lifetechnoliges(原ABI) 7900, Viaa 7 等可使用384微孔板的QPCR 仪器。

也可以定制其他机器形式:

Biotnt 可提供多种与以下qPCR仪器匹配的qPCR array类型。

重要提示:在订购前,请根据您的qPCR仪器型号选购合适的array类型;在收到产品后,请及时确认收到的array是否与您的qPCR仪器匹配。如果您的仪器类型不在下表所列类型中,请及时联系本公司技术支持咨询。

 

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900,ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900(standard 96well),ViiA7(standard 96well)

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block),7900HT(fast block),stepone plus,ViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCycler,MyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96,DNA Engine opticon,opticon 2,Chromo4

 

四.质量标准(QC


1. biotnt gene qPCR array中检测的基因引物,经实验验证结果分析,融解曲线均呈单一锐锋,电泳条带均呈单一条带,说明这些引物均是特异扩增引物,验证合格。

2. PTC(阳性对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于18~22之间。

3. RTC(spike-in反转录对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于17~23之间。

4. HGDC 的CT 值应大于35,说明样本中没有基因组污染。

5. RTC和 PTC的三重复CT 值应比较接近,说明实验重复性好。

6. 板与板之间(批内)重复性达0.99以上,具有高度重复性。

 

 

五.基因(引物)排布 :

每一个样本区里的基因排列如下:

 

 

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

基因1

基因2

基因3

基因4

基因5

基因6

基因7

基因8

基因9

基因10

基因11

基因12

B

基因13

基因14

基因15

基因16

基因17

基因18

基因19

基因20

基因21

基因22

基因23

基因24

C

基因25

基因26

基因27

基因28

基因29

基因30

基因31

基因32

基因33

基因34

基因35

基因36

D

基因37

基因38

基因39

基因40

基因41

基因42

基因43

基因44

基因45

基因46

基因47

基因48

E

基因49

基因50

基因51

基因52

基因53

基因54

基因55

基因56

基因57

基因58

基因59

基因60

F

基因61

基因62

基因63

基因64

基因65

基因66

基因67

基因68

基因69

基因70

基因71

基因72

G

基因73

基因74

基因75

基因76

基因77

基因78

基因79

基因80

基因81

基因82

基因83

基因84

H

HK1

HK2

HK3

GDC

GDC

GDC

RTC

RTC

RTC

PTC

PTC

PTC

 

& 基因引物:84个反应孔(从A排到G排)已预先交联好特异基因引物(详见基因引物列表)。

HK1-3:3条已交联的管家基因(内参)引物,可作为array数据标准化过程中样品的阳性对照。

&GDC:基因组DNA对照,可用于qPCR反应体系中是否有基因组DNA污染。

RTC:spike-in反转录对照,可用于检测RT反应的效率。这些已交联的引物可特异性扩增样品中外源性spike-in RNA反转录形成的cDNA模板。

PTC:阳性PCR对照,已交联DNA阳性质粒模板,主要用于实时监测array反应板的PCR扩增效率。

 

 

基因信息列表


  Symbol GeneBank
基因1 Abl1 NM_001100850
基因2 Acd NM_001037193
基因3 Akt1 NM_033230
基因4 Atm NM_001106821
基因5 Atp5c1 NM_053825
基因6 Bcl2 NM_016993
基因7 Blm NM_001107526
基因8 Cdk2 NM_199501
基因9 Chek1 NM_080400
基因10 Chek2 NM_053677
基因11 Dclre1b NM_001025687
基因12 Dclre1c NM_147145
基因13 Dkc1 NM_133419
基因14 Egf NM_012842
基因15 Eme1 NM_001105830
基因16 Ercc1 NM_001106228
基因17 Ercc4 XM_003754645
基因18 Esf1 NM_001100771
基因19 Hat1 NM_001009657
基因20 Heatr1 NM_001108418
基因21 Hnrnpa2b1 NM_001104613
基因22 Hnrpd NM_024404
基因23 Hsp90aa1 NM_175761
基因24 Hspa1l NM_212546
基因25 Igf1 NM_178866
基因26 Impdh2 NM_199099
基因27 Kras NM_031515
基因28 Krit1 NM_001108618
基因29 Mapre1 NM_138509
基因30 Men1 NM_019208
基因31 Mre11a NM_022279
基因32 Msh2 NM_031058
基因33 Msh3 NM_001191957
基因34 Mus81 NM_001025645
基因35 Myc NM_012603
基因36 Nbn NM_138873
基因37 Nhp2 NM_001105779
基因38 Nop56 NM_001025732
基因39 Obfc1 NM_001011943
基因40 Parp1 NM_013063
基因41 Pax8 NM_031141
基因42 Pinx1 NM_001083337
基因43 Plk1 NM_017100
基因44 Pparg NM_013124
基因45 Ppp2r1a NM_057140
基因46 Ppp2r1b NM_001025418
基因47 Ppp2r2b NM_022209
基因48 Prkca NM_001105713
基因49 Prkcb NM_012713
基因50 Prkdc NM_001108327
基因51 Ptges3l1 NM_001014272
基因52 Pura XM_006222540
基因53 Rad17 NM_001024778
基因54 Rad50 NM_022246
基因55 Rap1a NM_001005765
基因56 Rapgef1 XM_006224325
基因57 Rasa1 NM_013135
基因58 Rassf1 NM_001007754
基因59 Rb1 NM_017045
基因60 Rfc1 NM_053547
基因61 Sart1 NM_031596
基因62 Sirt2 NM_001008368
基因63 Sirt6 NM_001031649
基因64 Smad3 NM_013095
基因65 Smg6 NM_001105808
基因66 Snrpn NM_031117
基因67 Sp1 NM_012655
基因68 Ssb NM_031119
基因69 Tep1 NM_022591
基因70 Terf1 NM_001012464
基因71 Terf2 NM_001108448
基因72 Terf2ip NM_001013143
基因73 Tert NM_053423
基因74 Tgfb1 NM_021578
基因75 Tinf2 NM_001006962
基因76 Tnks NM_001106084
基因77 Tnks2 NM_001107607
基因78 Tp53 NM_030989
基因79 Tp53bp1 NM_001106501
基因80 Tpp1 NM_031357
基因81 Sun1 NM_001007147
基因82 Wrap53 NM_001007610
基因83 Xrcc5 NM_177419
基因84 Xrcc6 NM_139080

1.     任何一台能够做QPCR的仪器据能够做PCRarray吗?

回答:基本上任意一台的QPCR 仪器都可以进行QPCR array的实验。

BioTNT根据仪器采用的96孔或者384孔板,分为以下5种板型(plate format

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900standard 96well),ViiA7standard 96well

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block)7900HTfast block),stepone plusViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCyclerMyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96DNA Engine opticonopticon 2Chromo4

请您在订购时提供您使用的QPCR 仪器,我们也可以为您确定plate format;如果您的仪器不在以上清单上,也可以邮件咨询我们,我们会有专业的技术人员为您确定相应的plate format

 

2. BioTNT PCR array的适用在哪里?

回答:适用现有的通路研究;

适用少样本或中等样本,多基因的QPCR 检测;

在低样本或中等样本的情况下,费用和时间远小于自行建立QPCR实验;

使用方便,操作简单,结果稳定性好;

 

3. BioTNT PCR array的优点是什么?

回答:灵敏度高,样本使用量低;

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因;

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一;

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环;

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 

4. QPCR 得到实验数据后,如何进行后续的结果分析?需要配套的仪器设备吗?

回答: 您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击分析工具,然后再点击:分析软件下载下载后进行分析。不需要特殊的分析仪器。

 

5.   BioTNT PCR array,如果自己使用,需要购买哪些配套产品?

回答:您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击相关产品;

建议除了您要使用的PCR array 产品之外,您应购买以下产品,对PCR array进行配套使用:

PCR array cDNA第一链合成试剂盒 A2010B0B03  
Real time 染料PCR PreMIX A2010A0112
建议使用高品质的抽提试剂盒,推荐型号为:

Qiagen RNeasy Mini Kit (50) 74104
RNase-Free DNase Set (50)79254 

 

6. 如果使用其他公司的抽提试剂盒,如Trizol 法抽提试剂盒,能否使用BioTNTPCR array产品?

回答:建议抽提时尽量使用高质量的样本,高质量的抽提试剂盒,并在抽提时进行DNA 去除;使用PCR array 产品前,先进行样本质量的验证。能够通过样本质量验证的样本,可以进行PCR array实验。

 

7. 如何进行PCR array 实验前的样本质量验证?

回答:为了保证PCR array实验的质量,建议在使用前先进行样本质量验证;

RNA 定量与质量控制

A.  使用无菌水(RNase-free)稀释 RNA 样本,检测 260  nm  280  nm 吸光值,A260/280 应大于 1.8

B.  使用公式A260× 40 ×稀释倍数  = XXXXμg/mL 计算 RNA 浓度。

C.  使用琼脂糖凝胶电泳检测 RNA 完整性。

D.  建议:RNA 质量测定后,逆转录得到CDNA,建议用多个内参基因自行验证CDNA 质量;

推荐购买biotnt 的样本质量验证引物套装,可以在进行QPCR 之前对样本进行验证(包含内参引物,如human beta actin GAPDH,  18sRNA)

E.  基因组DNA污染控制

每个Array板块上的GDC(Genomic  DNA  Control)反应孔专为检测每个样品进行qPCR反应时可能存在的基因组DNA污染而设置。如果该反应孔的CT值小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。因此,必须从RNA样品中去除基因组和其他全部残余污染物。建议采用Qiagen 柱式抽提过程中加入DNAse去除基因组污染。

建议在进行PCR array 之前购买BioTNT 样本质量验证引物套装或者单独的GDC 引物进行基因组DNA 污染控制的质量验证;验证结果CT 值如果小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。

 

8. 如何进行样本的调平?

回答:进行PCR array之前,对样本需要进行调平。具体调平方式为:  

1.     RNA 含量调平:实验样本的RNA 尽量调到同一水平;加入RNA free的水,调整RNA浓度;

2.   调平后的样本:通过内参引物进行验证,根据CT 值,进行二次调平。

 

9. BioTNT PCR array定制费用如何?

回答:目前BioTNT PCR array 提供您的定制,仅比预制产品增加了400/板的定制费用。您可以把您要检测的指标给我们,然后把您的仪器型号,以及sample 数量,重复数量提供给我们,我们为您设置相应的PCR array 形式,并核算相应的费用给您。

BioTNT PCR array的定制,方式灵活,1 plate起订。

详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击定制服务

 

10.        如果我没有QPCR 仪器,BioTNT 能够提供什么服务?

回答:您可以选择BioTNT PCR array service

     详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击service

 

 

 

产品咨询:sales@biotnt.com    BioTNT订阅号:
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2. 由于某些产品的英文名较多,可更换关键词搜索;
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