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PCR Array

一、产品介绍:


PCR Array



BioTNT qPCR Array专为检测不同组织或细胞中特定基因的表达量而设计,这些基因按照预制或定制要求成套设置。检测结果所显示的表达差异可帮助研究者鉴定或验证这些基因的生物学意义,以及与其研究的重要相关性。

对于目录(预制)产品,每块384孔板包含84对PCR引物,可以进行4个样本单孔或者两个样本双复的实验。这些引物全部经过预先验证,并包被于指定的板孔中。在同一块96孔板上,有12个(384孔板有48个)反应孔包被了不同类型的对照,用以检测从反转录到qPCR整个过程的反应效率。

逆转录试剂和以荧光染料SYBR®Green 为基础的定量检测试剂作为被推荐的RT-qPCR试剂产品可与qPCR Array配套使用。该系列试剂均经过优化,具有高的灵敏度、效率和特异性。其他公司的类似试剂可能适用,但未验证过,不推荐使用。

 

二、产品优势


 灵敏度高,样本使用量低


线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因


每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一


重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环


覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究


定制产品可根据客户要求选择设置


数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 

 

三.运输和储存条件:


-20℃储存

 

 

四.适用仪器:


plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

384well

lifetechnologies

7900,ViiA7(384 well block)

96 well

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900(standard 96well),ViiA7(standard 96well)

96 well

lifetechnologies

7500(fast block),7900HT(fast block),stepone plus,ViiA 7(Fast block)

96 well

Biorad

iCycler,MyiQ, iQ5

96 well

Biorad

CFX96,DNA Engine opticon,opticon 2,Chromo4

 

五.质量标准(QC


1. biotnt gene qPCR array中检测的基因引物,经实验验证结果分析,融解曲线均呈单一锐锋,电泳条带均呈单一条带,说明这些引物均是特异扩增引物,验证合格。

2. PTC(阳性对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于18~22之间。

3. RTC(spike-in反转录对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于17~23之间。

4. HGDC 的CT 值应大于35,说明样本中没有基因组污染。

5. RTC和 PTC的三重复CT 值应比较接近,说明实验重复性好。

6. 板与板之间(批内)重复性达0.99以上,具有高度重复性。

 

 

六.基因(引物)排布 :

每一个样本区里的基因排列如下:

 

 

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

基因1

基因2

基因3

基因4

基因5

基因6

基因7

基因8

基因9

基因10

基因11

基因12

B

基因13

基因14

基因15

基因16

基因17

基因18

基因19

基因20

基因21

基因22

基因23

基因24

C

基因25

基因26

基因27

基因28

基因29

基因30

基因31

基因32

基因33

基因34

基因35

基因36

D

基因37

基因38

基因39

基因40

基因41

基因42

基因43

基因44

基因45

基因46

基因47

基因48

E

基因49

基因50

基因51

基因52

基因53

基因54

基因55

基因56

基因57

基因58

基因59

基因60

F

基因61

基因62

基因63

基因64

基因65

基因66

基因67

基因68

基因69

基因70

基因71

基因72

G

基因73

基因74

基因75

基因76

基因77

基因78

基因79

基因80

基因81

基因82

基因83

基因84

H

HK1

HK2

HK3

HGDC

HGDC

HGDC

RTC

RTC

RTC

PTC

PTC

PTC

 

& 基因引物:84个反应孔(从A排到G排)已预先交联好特异基因引物(详见基因引物列表)。

& HK1-3:3条已交联的管家基因(内参)引物,可作为array数据标准化过程中样品的阳性对照。

&HGDC:基因组DNA对照,可用于qPCR反应体系中是否有基因组DNA污染。

& RTC:spike-in反转录对照,可用于检测RT反应的效率。这些已交联的引物可特异性扩增样品中外源性spike-in RNA反转录形成的cDNA模板。

& PTC:阳性PCR对照,已交联DNA阳性质粒模板,主要用于实时监测array反应板的PCR扩增效率。 

  

  

推荐:

Human Signal Transduction PathwayFinder PCR Array,人信号转导通路finder PCR arrayHU-STPF-084

Mouse Signal Transduction PathwayFinder PCR Array, 小鼠信号转导通路finder PCR array, 货号:MS-STPF-084

Rat Signal Transduction PathwayFinder PCR Array大鼠信号转导通路finder PCR array  货号:RA-STPF-084)

 

信号转导通路finder PCR array简介:

这个芯片汇集了10个常用的信号通路的关键基因,包括TGFß PathwayWNT PathwayNFκB PathwayJAK/STAT Pathwayp53 PathwayNotch PathwayHedgehog PathwayPPAR PathwayHedgehog Pathway Hypoxia Pathway;可以从中筛选到起作用的信号通路,观察在这些通路上基因是否激活或者受到抑制。QPCR array 提供了您一个非常可信并且容易分析的实验方法。

您可以采用本预制信号通路PCR array 也可以从中间挑选部分通路或者部分基因,进行信号通路的定制。

 

Human Signal Transduction PathwayFinder PCR Array: HU-STPF-084          

Human 信号通路finder PCR array

                                                                                                                                                                                             

TGFß Pathway: ATF4, CDKN1B (p27KIP1), EMP1, GADD45B, HERPUD1, IFRD1, MYC, TNFSF10 (TRAIL).

 

WNT Pathway: AXIN2, CCND1, CCND2, DAB2, FOSL1 (FRA-1), MMP7 (Matrilysin), MYC, PPARD, WISP1.

 

NFκB Pathway: BCL2A1 (Bfl-1/A1), BCL2L1 (BCL-X), BIRC3 (c-IAP1), CCL5 (RANTES), CSF1 (MCSF), ICAM1, IFNG, STAT1, TNF.

 

JAK/STAT Pathway
JAK1, 2 / STAT1: IRF1.
STAT3:
 BCL2L1 (BCL-X), CCND1, CEBPD, LRG1, MCL1, SOCS3.
STAT5:
 BCL2L1 (BCL-X), CCND1, SOCS3.
JAK1, 3 / STAT6:
 FCER2, GATA3.

 

p53 Pathway: BAX, BBC3, BTG2, CDKN1A (p21CIP1/WAF1), EGFR, FAS (TNFRSF6), GADD45A, PCNA, RB1.

 

Notch Pathway:  HES1, HES5, HEY1, HEY2, HEYL, ID1, JAG1, LFNG, NOTCH1.

 

Hedgehog Pathway: BCL2, BMP2, BMP4, PTCH1, WNT1, WNT2B, WNT3A, WNT5A, WNT6.

 

PPAR Pathway:   ACSL3, ACSL4, ACSL5, CPT2, FABP1, OLR1, SLC27A4, SORBS1.

 

Oxidative Stress:  FTH1, GCLC, GCLM, GSR, HMOX1, NQO1, SQSTM1, TXN, TXNRD1.

 

Hypoxia: ADM, ARNT, CA9, EPO, HMOX1, LDHA, SERPINE1 (PAI-1), SLC2A1, VEGFA.

 

Mouse Signal Transduction PathwayFinder PCR Array小鼠信号通路finder PCR array::MS-STPF-084

TGFß Pathway: Atf4, Cdkn1b (p27Kip1), Emp1, Gadd45b, Herpud1, Ifrd1, Myc, Tnfsf10 (Trail).

 

WNT Pathway: Axin2, Ccnd1, Ccnd2, Dab2, Fosl1 (Fra-1), Mmp7 (Matrilysin), Myc, Ppard, Wisp1.

 

NFκB Pathway: Bcl2a1a (Bfl-1/A1), Bcl2l1 (Bcl-x), Birc3 (c-IAP1), Ccl5 (Rantes), Csf1 (Mcsf), Icam1, Ifng, Stat1, Tnf.

 

JAK/STAT Pathway:JAK1, 2 / STAT1: Irf1.


STAT3: Bcl2l1 (Bcl-x), Ccnd1, Cebpd, Lrg1, Mcl1, Socs3. 


STAT5: Bcl2l1 (Bcl-x), Ccnd1, Socs3.JAK1, 3 / STAT6: Fcer2a, Gata3.

 

p53 Pathway: Bax, Bbc3, Btg2, Cdkn1a (p21Cip1/Waf1), Egfr, Fas (Tnfrsf6), Gadd45a, Pcna, Rb1.

 

Notch Pathway: Hes1, Hes5, Hey1, Hey2, Heyl, Id1, Jag1, Lfng, Notch1.

 

Hedgehog Pathway: Bcl2, Bmp2, Bmp4, Ptch1, Wnt1, Wnt2b, Wnt3a, Wnt5a, Wnt6.

 

PPAR Pathway: Acsl3, Acsl4, Acsl5, Cpt2, Fabp1, Olr1, Slc27a4, Sorbs1.

 

Oxidative Stress: Fth1, Gclc, Gclm, Gsr, Hmox1, Nqo1, Sqstm1, Txn1, Txnrd1.

 

Hypoxia: Adm, Arnt, Car9, Epo, Hmox1, Ldha, Serpine1 (PAI-1), Slc2a1, Vegfa.

 

 

Rat Signal Transduction PathwayFinder PCR Array,大鼠信号通路finder PCR array  货号:RA-STPF-084

TGFβ Pathway: Atf4, Cdkn1b (p27Kip1), Emp1, Gadd45b, Herpud1, Ifrd1, Myc, Tnfsf10 (Trail).

 

WNT Pathway: Axin2, Ccnd1, Ccnd2, Dab2, Fosl1 (Fra-1), Mmp7 (Matrilysin), Myc, Ppard, Wisp1.

 

NF?B Pathway: Bcl2a1 (Bfl-1/A1), Bcl2l1 (Bcl-x), Birc3 (c-IAP1), Ccl5 (Rantes), Csf1 (Mcsf), Icam1, Ifng, Stat1, Tnf.

 

JAK/STAT Pathway:JAK1, 2 / STAT1: Irf1.


STAT3: Bcl2l1 (Bcl-x), Ccnd1, Cebpd, Lrg1, Mcl1, Socs3. 


STAT5: Bcl2l1 (Bcl-x), Ccnd1, Socs3.JAK1, 3 / STAT6: Fcer2, Gata3.

 

p53 Pathway: Bax, Bbc3, Btg2, Cdkn1a (p21Cip1/Waf1), Egfr, Fas (Tnfrsf6), Gadd45a, Pcna, Rb1.

 

Notch Pathway: Hes1, Hes5, Hey1, Hey2, Heyl, Id1, Jag1, Lfng, Notch1.

 

Hedgehog Pathway: Bcl2, Bmp2, Bmp4, Ptch1, Wnt1, Wnt2b, Wnt3a, Wnt5a, Wnt6.

 

PPAR Pathway: Acsl3, Acsl4, Acsl5, Cpt2, Fabp1, Olr1, Slc27a4, Sorbs1.

 

Oxidative Stress: Fth1, Gclc, Gclm, Gsr, Hmox1, Nqo1, Sqstm1, Txn1, Txnrd1.

 

Hypoxia: Adm, Arnt, Car9, Epo, Hmox1, Ldha, Serpine1 (PAI-1), Slc2a1, Vegfa.

 


推荐2:Human Stress & Toxicity PathwayFinderPCR Array(人应激和毒性pathwayfinder PCR Array)

介绍:这是一款通用的人应激和毒性pathwayfinder:

Oxidative Stress(氧化应激): FTH1, GCLC, GCLM, GSR, GSTP1, HMOX1,NQO1, PRDX1, SQSTM1, TXN, TXNRD1.

 

Hypoxia: ADM, ARNT, BNIP3L, CA9, EPO, HMOX1, LDHA, MMP9(Gelatinase B), SERPINE1 (PAI-1), SLC2A1, VEGFA.

Osmotic Stress(渗透性应激: AKR1B1, AQP1, AQP2, AQP4, CFTR, EDN1,HSPA4L, NFAT5, SLC5A3.                                               

Cell Death(细胞死亡): 

Apoptosis: CASP1 (ICE), FAS, MCL1, TNFRSF10A,TNFRSF10B (DR5), TNFRSF1A.

Autophagy: ATG5, ATG7, ATG12, BECN1, FAS, ULK1.

Necrosis:FAS (TNFRSF6), GRB2, PARP1 (ADPRT1), PVR, RIPK1,TNFRSF10A, TNFRSF1A, TXNL4B.

Inflammatory Response(炎症应答):CCL2 (MCP-1), CD40LG (TNFSF5), CRP,IFNG, IL1A, IL1B, IL6, IL8, TLR4, TNF.

DNA Damage Signaling (DNA损伤): 

Cell Cycle Checkpoint/Arrest: CDKN1A (p21CIP1/WAF1), CHEK1, CHEK2(RAD53), DDIT3 (GADD153/CHOP), HUS1, MRE11A, NBN (NBS1), RAD17, RAD9A.

Other Responses: ATM, ATR, DDB2, GADD45A, GADD45G,RAD51, TP53, XPC.

Heat Shock Proteins/Unfolded Protein Response热休克蛋白等): ATF4, ATF6, ATF6B, BBC3, BID, CALR,DDIT3, DNAJC3, HSP90AA1, HSP90B1 (TRA1), HSPA4 (HSP70), HSPA5 (GRP78).

 

推荐3:Human Cancer PathwayFinder PCR Array(人癌症Pathway Finder PCR Array)

介绍:这是一款通用的癌症pathwayfinder,包括细胞循环/DNA 损伤修复;

Cell Cycle Control & DNA DamageRepair(细胞循环/DNA 损伤修复):

ATM, BRCA1, CCNE1 (cyclin E1), CDC25A,CDK2, CDK4, CDKN1A (p21Waf1), CDKN2A (p16Ink4), CHEK2 (chk2 / Rad53), E2F1,MDM2, RB1, S100A4, TP53 (p53).

Apoptosis and Cell Senescence(细胞凋亡和细胞衰老):

APAF1, BAD, BAX, BCL2, BCL2L1 (bcl-X),CASP8, CFLAR (CASPER), FAS, GZMA, HTATIP2, TERT (telomerase), TNFRSF1A (TNF-areceptor), TNFRSF10B (DR5), TNFRSF25 (DR3).

Signal Transduction Molecules andTranscription Factors(信号转导分子和转录因子):

AKT1, ERBB2, ETS2, FOS, JUN, MAP2K1