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BioTNT PCR ARRAY of Rat TGFb / BMP Signaling Pat…
    产品中心    >>  试剂    >>  分子生物学试剂    >>  PCR Array 关   闭
PCR ARRAY of Rat TGFb / BMP Signaling Pathway Rat+ primer
分类:PCR Array
品牌:BioTNT
货号:A2020A0156R/B
原价:7200
现价:¥5538.00    节省:¥1662
特异性种属:rat
规格:250板
产品参数

一、产品介绍:


PCR Array

 

 

BioTNT qPCR Array专为检测不同组织或细胞中特定基因的表达量而设计,这些基因按照预制或定制要求成套设置。检测结果所显示的表达差异可帮助研究者鉴定或验证这些基因的生物学意义,以及与其研究的重要相关性。

对于目录(预制)产品,每块384孔板包含84对PCR引物,可以进行4个样本单孔或者两个样本双复的实验。这些引物全部经过预先验证,并包被于指定的板孔中。在同一块96孔板上,有12个(384孔板有48个)反应孔包被了不同类型的对照,用以检测从反转录到qPCR整个过程的反应效率。

逆转录试剂和以荧光染料SYBR?Green 为基础的定量检测试剂作为被推荐的RT-qPCR试剂产品可与qPCR Array配套使用。该系列试剂均经过优化,具有高的灵敏度、效率和特异性。其他公司的类似试剂可能适用,但未验证过,不推荐使用。

 

产品优势


BioTNT QPCR芯片特点:

灵敏度高,样本使用量低

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 


产品说明


The Rat TGFβ / BMP Signaling Pathway RT2 Profiler? PCR Array profiles the expression of 84 genes related to TGFβ BMP-mediated signal transduction. The array includes members of the TGFβ superfamily of cytokines and their receptors. SMAD and SMAD target genes are included. Related genes including adhesion and extracellular molecules and transcription factors are included as well. Some of the genes involved in downstream cellular and developmental processes are also represented. Using real-time PCR, you can easily and reliably analyze expression of a focused panel of genes related to TGFβ BMP-mediated signal transduction with this array.

 

 

二.运输和储存条件:


4度运输。

-20°C储存至少6个月;

 

 

三.适用仪器:


lifetechnoliges(原ABI) 7900, Viaa 7 等可使用384微孔板的QPCR 仪器。

也可以定制其他机器形式:

Biotnt 可提供多种与以下qPCR仪器匹配的qPCR array类型。

重要提示:在订购前,请根据您的qPCR仪器型号选购合适的array类型;在收到产品后,请及时确认收到的array是否与您的qPCR仪器匹配。如果您的仪器类型不在下表所列类型中,请及时联系本公司技术支持咨询。

 

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900,ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900(standard 96well),ViiA7(standard 96well)

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block),7900HT(fast block),stepone plus,ViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCycler,MyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96,DNA Engine opticon,opticon 2,Chromo4

 

四.质量标准(QC


1. biotnt gene qPCR array中检测的基因引物,经实验验证结果分析,融解曲线均呈单一锐锋,电泳条带均呈单一条带,说明这些引物均是特异扩增引物,验证合格。

2. PTC(阳性对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于18~22之间。

3. RTC(spike-in反转录对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于17~23之间。

4. HGDC 的CT 值应大于35,说明样本中没有基因组污染。

5. RTC和 PTC的三重复CT 值应比较接近,说明实验重复性好。

6. 板与板之间(批内)重复性达0.99以上,具有高度重复性。

 

 

五.基因(引物)排布 :

每一个样本区里的基因排列如下:

 

 

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

基因1

基因2

基因3

基因4

基因5

基因6

基因7

基因8

基因9

基因10

基因11

基因12

B

基因13

基因14

基因15

基因16

基因17

基因18

基因19

基因20

基因21

基因22

基因23

基因24

C

基因25

基因26

基因27

基因28

基因29

基因30

基因31

基因32

基因33

基因34

基因35

基因36

D

基因37

基因38

基因39

基因40

基因41

基因42

基因43

基因44

基因45

基因46

基因47

基因48

E

基因49

基因50

基因51

基因52

基因53

基因54

基因55

基因56

基因57

基因58

基因59

基因60

F

基因61

基因62

基因63

基因64

基因65

基因66

基因67

基因68

基因69

基因70

基因71

基因72

G

基因73

基因74

基因75

基因76

基因77

基因78

基因79

基因80

基因81

基因82

基因83

基因84

H

HK1

HK2

HK3

GDC

GDC

GDC

RTC

RTC

RTC

PTC

PTC

PTC

 

& 基因引物:84个反应孔(从A排到G排)已预先交联好特异基因引物(详见基因引物列表)。

HK1-3:3条已交联的管家基因(内参)引物,可作为array数据标准化过程中样品的阳性对照。

&GDC:基因组DNA对照,可用于qPCR反应体系中是否有基因组DNA污染。

RTC:spike-in反转录对照,可用于检测RT反应的效率。这些已交联的引物可特异性扩增样品中外源性spike-in RNA反转录形成的cDNA模板。

PTC:阳性PCR对照,已交联DNA阳性质粒模板,主要用于实时监测array反应板的PCR扩增效率。

 

 

基因信息列表


  Symbol GeneBank
基因1 Acvr1 NM_024486
基因2 Acvr2a NM_031571
基因3 Acvrl1 NM_022441
基因4 Amh NM_012902
基因5 Amhr2 NM_030998
基因6 Atf4 NM_024403
基因7 Bambi NM_139082
基因8 Bglap NM_013414
基因9 Bmp1 NM_031323
基因10 Bmp2 NM_017178
基因11 Bmp3 NM_017105
基因12 Bmp4 NM_012827
基因13 Bmp5 NM_001108168
基因14 Bmp6 NM_013107
基因15 Bmp7 NM_001191856
基因16 Bmper NM_001135799
基因17 Bmpr1a NM_030849
基因18 Bmpr1b NM_001024259
基因19 Bmpr2 NM_080407
基因20 Cdkn1a NM_080782
基因21 Cdkn1b NM_031762
基因22 Cdkn2b NM_130812
基因23 Chrd NM_057134
基因24 Col1a1 NM_053304
基因25 Col1a2 NM_053356
基因26 Dcn NM_024129
基因27 Dlx2 NM_001191746
基因28 Emp1 NM_012843
基因29 Eng NM_001010968
基因30 Fos NM_022197
基因31 Fst NM_012561
基因32 Gadd45b NM_001008321
基因33 Gdf3 NM_001109671
基因34 Gdf5 XM_001066344
基因35 Gdf6 NM_001013038
基因36 Gdf7 NM_001170350
基因37 Gsc NM_001191873
基因38 Herpud1 NM_053523
基因39 Hipk2 NM_001108622
基因40 Id1 NM_012797
基因41 Id2 NM_013060
基因42 Ifrd1 NM_019242
基因43 Igf1 NM_178866
基因44 Igfbp3 NM_012588
基因45 Il6 NM_012589
基因46 Inha NM_012590
基因47 Inhba NM_017128
基因48 Inhbb NM_080771
基因49 Jun NM_021835
基因50 Junb NM_021836
基因51 Ltbp1 NM_021587
基因52 Ltbp2 NM_021586
基因53 Mecom NM_001106423
基因54 Myc NM_012603
基因55 Nodal NM_001106394
基因56 Nog NM_012990
基因57 Pdgfb NM_031524
基因58 Plat NM_013151
基因59 Plau NM_013085
基因60 Runx1 NM_017325
基因61 Serpine1 NM_012620
基因62 Smad1 NM_013130
基因63 Smad2 NM_019191
基因64 Smad3 NM_013095
基因65 Smad4 NM_019275
基因66 Smad5 NM_021692
基因67 Smad6 NM_001109002
基因68 Smad7 NM_030858
基因69 Sox4 NM_001271205
基因70 Stat1 NM_032612
基因71 Tdgf1 XM_001056317
基因72 Tgfb1 NM_021578
基因73 Tgfb1i1 NM_001191840
基因74 Tgfb2 NM_031131
基因75 Tgfb3 NM_013174
基因76 Tgfbi NM_053802
基因77 Tgfbr1 NM_012775
基因78 Tgfbr2 NM_031132
基因79 Tgfbr3 NM_017256
基因80 Tgfbrap1 NM_001106907
基因81 Tgif1 NM_001015020
基因82 Thbs1 NM_001013062
基因83 Tnfsf10 NM_145681
基因84 Tsc22d1 NM_001109912

1.     任何一台能够做QPCR的仪器据能够做PCRarray吗?

回答:基本上任意一台的QPCR 仪器都可以进行QPCR array的实验。

BioTNT根据仪器采用的96孔或者384孔板,分为以下5种板型(plate format

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900standard 96well),ViiA7standard 96well

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block)7900HTfast block),stepone plusViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCyclerMyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96DNA Engine opticonopticon 2Chromo4

请您在订购时提供您使用的QPCR 仪器,我们也可以为您确定plate format;如果您的仪器不在以上清单上,也可以邮件咨询我们,我们会有专业的技术人员为您确定相应的plate format

 

2. BioTNT PCR array的适用在哪里?

回答:适用现有的通路研究;

适用少样本或中等样本,多基因的QPCR 检测;

在低样本或中等样本的情况下,费用和时间远小于自行建立QPCR实验;

使用方便,操作简单,结果稳定性好;

 

3. BioTNT PCR array的优点是什么?

回答:灵敏度高,样本使用量低;

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因;

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一;

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环;

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 

4. QPCR 得到实验数据后,如何进行后续的结果分析?需要配套的仪器设备吗?

回答: 您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击分析工具,然后再点击:分析软件下载下载后进行分析。不需要特殊的分析仪器。

 

5.   BioTNT PCR array,如果自己使用,需要购买哪些配套产品?

回答:您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击相关产品;

建议除了您要使用的PCR array 产品之外,您应购买以下产品,对PCR array进行配套使用:

PCR array cDNA第一链合成试剂盒 A2010B0B03  
Real time 染料PCR PreMIX A2010A0112
建议使用高品质的抽提试剂盒,推荐型号为:

Qiagen RNeasy Mini Kit (50) 74104
RNase-Free DNase Set (50)79254 

 

6. 如果使用其他公司的抽提试剂盒,如Trizol 法抽提试剂盒,能否使用BioTNTPCR array产品?

回答:建议抽提时尽量使用高质量的样本,高质量的抽提试剂盒,并在抽提时进行DNA 去除;使用PCR array 产品前,先进行样本质量的验证。能够通过样本质量验证的样本,可以进行PCR array实验。

 

7. 如何进行PCR array 实验前的样本质量验证?

回答:为了保证PCR array实验的质量,建议在使用前先进行样本质量验证;

RNA 定量与质量控制

A.  使用无菌水(RNase-free)稀释 RNA 样本,检测 260  nm  280  nm 吸光值,A260/280 应大于 1.8

B.  使用公式A260× 40 ×稀释倍数  = XXXXμg/mL 计算 RNA 浓度。

C.  使用琼脂糖凝胶电泳检测 RNA 完整性。

D.  建议:RNA 质量测定后,逆转录得到CDNA,建议用多个内参基因自行验证CDNA 质量;

推荐购买biotnt 的样本质量验证引物套装,可以在进行QPCR 之前对样本进行验证(包含内参引物,如human beta actin GAPDH,  18sRNA)

E.  基因组DNA污染控制

每个Array板块上的GDC(Genomic  DNA  Control)反应孔专为检测每个样品进行qPCR反应时可能存在的基因组DNA污染而设置。如果该反应孔的CT值小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。因此,必须从RNA样品中去除基因组和其他全部残余污染物。建议采用Qiagen 柱式抽提过程中加入DNAse去除基因组污染。

建议在进行PCR array 之前购买BioTNT 样本质量验证引物套装或者单独的GDC 引物进行基因组DNA 污染控制的质量验证;验证结果CT 值如果小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。

 

8. 如何进行样本的调平?

回答:进行PCR array之前,对样本需要进行调平。具体调平方式为:  

1.     RNA 含量调平:实验样本的RNA 尽量调到同一水平;加入RNA free的水,调整RNA浓度;

2.   调平后的样本:通过内参引物进行验证,根据CT 值,进行二次调平。

 

9. BioTNT PCR array定制费用如何?

回答:目前BioTNT PCR array 提供您的定制,仅比预制产品增加了400/板的定制费用。您可以把您要检测的指标给我们,然后把您的仪器型号,以及sample 数量,重复数量提供给我们,我们为您设置相应的PCR array 形式,并核算相应的费用给您。

BioTNT PCR array的定制,方式灵活,1 plate起订。

详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击定制服务

 

10.        如果我没有QPCR 仪器,BioTNT 能够提供什么服务?

回答:您可以选择BioTNT PCR array service

     详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击service

 

 

 

产品咨询:sales@biotnt.com    BioTNT订阅号:
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产品搜索说明:
 
1. 搜索产品时先要选择搜索条件:品名搜索和货号搜索,搜索到产品列表时,可根据产品类别和品牌进行一次筛选;
2. 由于某些产品的英文名较多,可更换关键词搜索;
3. 当进行品名搜索时,切勿将品名和种类同时输入,否则就有可能搜索不到产品(例如:FAST Frame for Chip Kits - 4 Slide frame 生物芯片,将有可能搜索不到产品或者过多的产品);
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