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BioTNT PCR ARRAY of Mouse Glucose Metabolism-葡萄…
    产品中心    >>  试剂    >>  BioTNT核酸PCR相关    >>  PCR Array 关   闭
PCR ARRAY of Mouse Glucose Metabolism-葡萄糖代谢系列
分类:PCR Array
品牌:BioTNT
货号:A2020A0069M/S
原价:2083
现价:¥1602.00    节省:¥481
特异性种属:mouse
规格:96孔*2板
产品参数

一、产品介绍:


PCR Array

 

 

BioTNT qPCR Array专为检测不同组织或细胞中特定基因的表达量而设计,这些基因按照预制或定制要求成套设置。检测结果所显示的表达差异可帮助研究者鉴定或验证这些基因的生物学意义,以及与其研究的重要相关性。

对于目录(预制)产品,每块384孔板包含84对PCR引物,可以进行4个样本单孔或者两个样本双复的实验。这些引物全部经过预先验证,并包被于指定的板孔中。在同一块96孔板上,有12个(384孔板有48个)反应孔包被了不同类型的对照,用以检测从反转录到qPCR整个过程的反应效率。

逆转录试剂和以荧光染料SYBR?Green 为基础的定量检测试剂作为被推荐的RT-qPCR试剂产品可与qPCR Array配套使用。该系列试剂均经过优化,具有高的灵敏度、效率和特异性。其他公司的类似试剂可能适用,但未验证过,不推荐使用。

 

产品优势


BioTNT QPCR芯片特点:

灵敏度高,样本使用量低

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 

产品说明

 

   

The Mouse Glucose Metabolism   PCR Array profiles the expression of 84 key genes involved in the regulation and enzymatic pathways of glucose and glycogen metabolism. Glycolysis, the TCA cycle and the pentose phosphate pathways break down glucose from carbohydrates into the metabolites necessary for energy production, and gluconeogenesis stores excess energy as glucose. Cells, particularly in skeletal muscle and the liver, store excess glucose as the polysaccharide glycogen, and quickly metabolize it again when necessary. Changes in glucose metabolism gene expression are common in cancerous tissues. Specifically, tumors often show decreased oxidative phosphorylation, even in the presence of sufficient oxygen, due to enhanced transcription of glycolytic genes and/or reduced transcription of TCA cycle genes. In addition, the pathological consequences of diabetes and obesity involve gene expression changes in glucose metabolic pathways. In one notable example, PCK1 overexpression in mice leads to obesity. Using real-time PCR, you can easily and reliably analyze the expression of a focused panel of genes involved in glucose metabolism with this array.

二.运输和储存条件:


4度运输。

-20°C储存至少6个月;

 

 

三.适用仪器:


lifetechnoliges(原ABI) 7900, Viaa 7 等可使用384微孔板的QPCR 仪器。

也可以定制其他机器形式:

Biotnt 可提供多种与以下qPCR仪器匹配的qPCR array类型。

重要提示:在订购前,请根据您的qPCR仪器型号选购合适的array类型;在收到产品后,请及时确认收到的array是否与您的qPCR仪器匹配。如果您的仪器类型不在下表所列类型中,请及时联系本公司技术支持咨询。

 

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900,ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900(standard 96well),ViiA7(standard 96well)

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block),7900HT(fast block),stepone plus,ViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCycler,MyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96,DNA Engine opticon,opticon 2,Chromo4

 

四.质量标准(QC


1. biotnt gene qPCR array中检测的基因引物,经实验验证结果分析,融解曲线均呈单一锐锋,电泳条带均呈单一条带,说明这些引物均是特异扩增引物,验证合格。

2. PTC(阳性对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于18~22之间。

3. RTC(spike-in反转录对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于17~23之间。

4. HGDC 的CT 值应大于35,说明样本中没有基因组污染。

5. RTC和 PTC的三重复CT 值应比较接近,说明实验重复性好。

6. 板与板之间(批内)重复性达0.99以上,具有高度重复性。

 

 

五.基因(引物)排布 :

每一个样本区里的基因排列如下:

 

 

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

基因1

基因2

基因3

基因4

基因5

基因6

基因7

基因8

基因9

基因10

基因11

基因12

B

基因13

基因14

基因15

基因16

基因17

基因18

基因19

基因20

基因21

基因22

基因23

基因24

C

基因25

基因26

基因27

基因28

基因29

基因30

基因31

基因32

基因33

基因34

基因35

基因36

D

基因37

基因38

基因39

基因40

基因41

基因42

基因43

基因44

基因45

基因46

基因47

基因48

E

基因49

基因50

基因51

基因52

基因53

基因54

基因55

基因56

基因57

基因58

基因59

基因60

F

基因61

基因62

基因63

基因64

基因65

基因66

基因67

基因68

基因69

基因70

基因71

基因72

G

基因73

基因74

基因75

基因76

基因77

基因78

基因79

基因80

基因81

基因82

基因83

基因84

H

HK1

HK2

HK3

GDC

GDC

GDC

RTC

RTC

RTC

PTC

PTC

PTC

 

& 基因引物:84个反应孔(从A排到G排)已预先交联好特异基因引物(详见基因引物列表)。

HK1-3:3条已交联的管家基因(内参)引物,可作为array数据标准化过程中样品的阳性对照。

&GDC:基因组DNA对照,可用于qPCR反应体系中是否有基因组DNA污染。

RTC:spike-in反转录对照,可用于检测RT反应的效率。这些已交联的引物可特异性扩增样品中外源性spike-in RNA反转录形成的cDNA模板。

PTC:阳性PCR对照,已交联DNA阳性质粒模板,主要用于实时监测array反应板的PCR扩增效率。

 

 

基因引物列表

 

A2020A0069M

PCR Array of Mouse Glucose Metabolism

序号

简称

货号

基因ID

基因1

Acp5

tnt8948a

11433

基因2

Adcy10

tnt8409b

271639

基因3

Alox12

tnt5571a

11684

基因4

Alox15

tnt5572a

11687

基因5

Alox5

tnt8624a

11689

基因6

Alpl

tnt2191a

11647

基因7

Ar

QMP11835

11835

基因8

Bglap

tnt4307b

12096

基因9

Bmp2

tnt5337a

12156

基因10

Bmp7

tnt2028b

12162

基因11

Calca

tnt8088d

12310

基因12

Calcr

tnt5866b

12311

基因13

Car2

QMP12349

12349

基因14

Casr

tnt8920a

12374

基因15

Cd40

tnt8568a

21939

基因16

Clcn7

QMP26373

26373

基因17

Cnr2

tnt3342a

12802

基因18

Col1a1

tnt1162b

12842

基因19

Col1a2

tnt6448b

12843

基因20

Comt

tnt8344b

12846

基因21

Crtap

QMP56693

56693

基因22

Ctsk

tnt5865b

13038

基因23

Cyp17a1

tnt3194b

13074

基因24

Cyp19a1

QMP13075

13075

基因25

Dbp

tnt7352b

13170

基因26

Dkk1

tnt2002a

13380

基因27

Enpp1

QMP18605

18605

基因28

Esr1

tnt1114

13982

基因29

Esr2

tnt1115

13983

基因30

Esrra

tnt7785b

26379

基因31

Fgfr1

tnt7353b

14182

基因32

Fgfr2

tnt6620a

14183

基因33

Ghrh

QMP14601

14601

基因34

Hsd11b1

QMP15483

15483

基因35

Igf1

tnt5507a

16000

基因36

Igfbp2

QMP16008

16008

基因37

Il15

tnt3149a

16168

基因38

Il6

tnt5199d

16193

基因39

Il6ra

tnt3162b

16194

基因40

Itga1

QMP109700

109700

基因41

Itgb3

tnt2508b

16416

基因42

Lep

tnt1987b

16846

基因43

Lepre1

QMP56401

56401

基因44

Lrp1

QMP16971

16971

基因45

Lrp5

tnt2014a

16973

基因46

Lrp6

tnt8906a

16974

基因47

Lta

tnt2546a

16992

基因48

Ltbp2

QMP16997

16997

基因49

Mab21l2

QMP23937

23937

基因50

Mmp2

tnt5341b

17390

基因51

Mstn

QMP17700

17700

基因52

Mthfr

QMP17769

17769

基因53

Nfatc1

tnt1666a

18018

基因54

Nog

QMP18121

18121

基因55

Nos3

tnt6398b

18127

基因56

Npy

tnt8919a

109648

基因57

Nr3c1

tnt6552b

14815

基因58

P2rx7

tnt7908b

18439

基因59

Plod2

QMP26432

26432

基因60

Prl

QMP19109

19109

基因61

Pth

tnt1687b

19226

基因62

Pth1r

tnt7354a

19228

基因63

Pthlh

tnt1686b

19227

基因64

Runx2

tnt5338a

12393

基因65

Sfrp1

tnt7808a

20377

基因66

Sfrp4

tnt7687b

20379

基因67

Shbg

QMP20415

20415

基因68

Sost

tnt9562a

74499

基因69

Sparc

tnt5264b

20692

基因70

Spp1

tnt5376b

20750

基因71

Stat1

tnt6843b

20846

基因72

Tgfb1

tnt5340b

21803

基因73

Timp2

tnt2530a

21858

基因74

Tnfaip3

tnt4749b

21929

基因75

Tnfrsf11a

tnt9518a

21934

基因76

Tnfrsf11b

tnt3278b

18383

基因77

Tnfrsf1b

tnt2540b

21938

基因78

Tnfsf11

tnt6644a

21943

基因79

Tshr

QMP22095

22095

基因80

Twist1

tnt5392b

22160

基因81

Vdr

tnt7345a

22337

基因82

Vegfa

tnt5711b

22339

基因83

Wnt10b

tnt2045b

22410

基因84

Wnt3a

tnt1008c

22416

 

1.     任何一台能够做QPCR的仪器据能够做PCRarray吗?

回答:基本上任意一台的QPCR 仪器都可以进行QPCR array的实验。

BioTNT根据仪器采用的96孔或者384孔板,分为以下5种板型(plate format

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900standard 96well),ViiA7standard 96well

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block)7900HTfast block),stepone plusViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCyclerMyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96DNA Engine opticonopticon 2Chromo4

请您在订购时提供您使用的QPCR 仪器,我们也可以为您确定plate format;如果您的仪器不在以上清单上,也可以邮件咨询我们,我们会有专业的技术人员为您确定相应的plate format

 

2. BioTNT PCR array的适用在哪里?

回答:适用现有的通路研究;

适用少样本或中等样本,多基因的QPCR 检测;

在低样本或中等样本的情况下,费用和时间远小于自行建立QPCR实验;

使用方便,操作简单,结果稳定性好;

 

3. BioTNT PCR array的优点是什么?

回答:灵敏度高,样本使用量低;

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因;

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一;

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环;

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 

4. QPCR 得到实验数据后,如何进行后续的结果分析?需要配套的仪器设备吗?

回答: 您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击分析工具,然后再点击:分析软件下载下载后进行分析。不需要特殊的分析仪器。

 

5.   BioTNT PCR array,如果自己使用,需要购买哪些配套产品?

回答:您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击相关产品;

建议除了您要使用的PCR array 产品之外,您应购买以下产品,对PCR array进行配套使用:

PCR array cDNA第一链合成试剂盒 A2010B0B03  
Real time 染料PCR PreMIX A2010A0112
建议使用高品质的抽提试剂盒,推荐型号为:

Qiagen RNeasy Mini Kit (50) 74104
RNase-Free DNase Set (50)79254 

 

6. 如果使用其他公司的抽提试剂盒,如Trizol 法抽提试剂盒,能否使用BioTNTPCR array产品?

回答:建议抽提时尽量使用高质量的样本,高质量的抽提试剂盒,并在抽提时进行DNA 去除;使用PCR array 产品前,先进行样本质量的验证。能够通过样本质量验证的样本,可以进行PCR array实验。

 

7. 如何进行PCR array 实验前的样本质量验证?

回答:为了保证PCR array实验的质量,建议在使用前先进行样本质量验证;

RNA 定量与质量控制

A.  使用无菌水(RNase-free)稀释 RNA 样本,检测 260  nm  280  nm 吸光值,A260/280 应大于 1.8

B.  使用公式A260× 40 ×稀释倍数  = XXXXμg/mL 计算 RNA 浓度。

C.  使用琼脂糖凝胶电泳检测 RNA 完整性。

D.  建议:RNA 质量测定后,逆转录得到CDNA,建议用多个内参基因自行验证CDNA 质量;

推荐购买biotnt 的样本质量验证引物套装,可以在进行QPCR 之前对样本进行验证(包含内参引物,如human beta actin GAPDH,  18sRNA)

E.  基因组DNA污染控制

每个Array板块上的GDC(Genomic  DNA  Control)反应孔专为检测每个样品进行qPCR反应时可能存在的基因组DNA污染而设置。如果该反应孔的CT值小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。因此,必须从RNA样品中去除基因组和其他全部残余污染物。建议采用Qiagen 柱式抽提过程中加入DNAse去除基因组污染。

建议在进行PCR array 之前购买BioTNT 样本质量验证引物套装或者单独的GDC 引物进行基因组DNA 污染控制的质量验证;验证结果CT 值如果小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。

 

8. 如何进行样本的调平?

回答:进行PCR array之前,对样本需要进行调平。具体调平方式为:  

1.     RNA 含量调平:实验样本的RNA 尽量调到同一水平;加入RNA free的水,调整RNA浓度;

2.   调平后的样本:通过内参引物进行验证,根据CT 值,进行二次调平。

 

9. BioTNT PCR array定制费用如何?

回答:目前BioTNT PCR array 提供您的定制,仅比预制产品增加了400/板的定制费用。您可以把您要检测的指标给我们,然后把您的仪器型号,以及sample 数量,重复数量提供给我们,我们为您设置相应的PCR array 形式,并核算相应的费用给您。

BioTNT PCR array的定制,方式灵活,1 plate起订。

详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击定制服务

 

10.        如果我没有QPCR 仪器,BioTNT 能够提供什么服务?

回答:您可以选择BioTNT PCR array service

     详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击service

 

 

 

 

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