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BioTNT PCR ARRAY of Mouse Lung Cancer-肺癌系列
    产品中心    >>  试剂    >>  BioTNT核酸PCR相关    >>  PCR Array 关   闭
PCR ARRAY of Mouse Lung Cancer-肺癌系列
分类:PCR Array
品牌:BioTNT
货号:A2020A0097M/S
原价:2080
现价:¥1602.00    节省:¥478
特异性种属:mouse
规格:96孔*2板
产品参数

一、产品介绍:


PCR Array

 

 

BioTNT qPCR Array专为检测不同组织或细胞中特定基因的表达量而设计,这些基因按照预制或定制要求成套设置。检测结果所显示的表达差异可帮助研究者鉴定或验证这些基因的生物学意义,以及与其研究的重要相关性。

对于目录(预制)产品,每块384孔板包含84对PCR引物,可以进行4个样本单孔或者两个样本双复的实验。这些引物全部经过预先验证,并包被于指定的板孔中。在同一块96孔板上,有12个(384孔板有48个)反应孔包被了不同类型的对照,用以检测从反转录到qPCR整个过程的反应效率。

逆转录试剂和以荧光染料SYBR?Green 为基础的定量检测试剂作为被推荐的RT-qPCR试剂产品可与qPCR Array配套使用。该系列试剂均经过优化,具有高的灵敏度、效率和特异性。其他公司的类似试剂可能适用,但未验证过,不推荐使用。

 

产品优势


BioTNT QPCR芯片特点:

灵敏度高,样本使用量低

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 

产品说明

 

   

The Mouse Lung Cancer   PCR Array profiles the expression of 84 key genes commonly involved in lung cancer development. Most instances of lung cancer arise from cigarette smoking, but also exposure to other environmental hazards such as passive cigarette smoke, radon gas, asbestos, and viral infection. The major subtype of lung cancer in patients with smoking history, non-small-cell lung carcinoma (NSCLC), includes adenocarcinoma (AC) which derives from peripheral lung tissue and squamous-cell carcinoma (SCC) which derives from central bronchi. While the exact molecular mechanisms behind lung cancer are still under heavy investigation, tumor suppressor gene inhibition and oncogene activation play important roles. The affected tumor suppressors and oncogenes regulate immune response, apoptosis, cell cycle, PI3K/AKT, and cell adhesion pathways. Research directed at these pathways and genes differentially expressed in lung cancer subtypes versus normal tissue may yield insights into the molecular mechanisms behind lung oncogenesis. This array includes genes detected routinely in molecular analysis of lung cancer samples and discovered via high-throughput microarray profiling studies, as well as genes known to have differentially methylated promoters in lung cancer. Lung cancers tend to metastasize; therefore, the array includes genes associated with metastatic potential. Using real-time PCR, research studies can easily and reliably analyze the expression of a focused panel of genes involved in lung cancer initiation, progression, and metastasis with this array.

The   PCR Arrays are intended for molecular biology applications. This product is not intended for the diagnosis, prevention, or treatment of a disease.



二.运输和储存条件:


4度运输。

-20°C储存至少6个月;

 

 

三.适用仪器:


lifetechnoliges(原ABI) 7900, Viaa 7 等可使用384微孔板的QPCR 仪器。

也可以定制其他机器形式:

Biotnt 可提供多种与以下qPCR仪器匹配的qPCR array类型。

重要提示:在订购前,请根据您的qPCR仪器型号选购合适的array类型;在收到产品后,请及时确认收到的array是否与您的qPCR仪器匹配。如果您的仪器类型不在下表所列类型中,请及时联系本公司技术支持咨询。

 

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900,ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900(standard 96well),ViiA7(standard 96well)

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block),7900HT(fast block),stepone plus,ViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCycler,MyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96,DNA Engine opticon,opticon 2,Chromo4

 

四.质量标准(QC


1. biotnt gene qPCR array中检测的基因引物,经实验验证结果分析,融解曲线均呈单一锐锋,电泳条带均呈单一条带,说明这些引物均是特异扩增引物,验证合格。

2. PTC(阳性对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于18~22之间。

3. RTC(spike-in反转录对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于17~23之间。

4. HGDC 的CT 值应大于35,说明样本中没有基因组污染。

5. RTC和 PTC的三重复CT 值应比较接近,说明实验重复性好。

6. 板与板之间(批内)重复性达0.99以上,具有高度重复性。

 

 

五.基因(引物)排布 :

每一个样本区里的基因排列如下:

 

 

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

基因1

基因2

基因3

基因4

基因5

基因6

基因7

基因8

基因9

基因10

基因11

基因12

B

基因13

基因14

基因15

基因16

基因17

基因18

基因19

基因20

基因21

基因22

基因23

基因24

C

基因25

基因26

基因27

基因28

基因29

基因30

基因31

基因32

基因33

基因34

基因35

基因36

D

基因37

基因38

基因39

基因40

基因41

基因42

基因43

基因44

基因45

基因46

基因47

基因48

E

基因49

基因50

基因51

基因52

基因53

基因54

基因55

基因56

基因57

基因58

基因59

基因60

F

基因61

基因62

基因63

基因64

基因65

基因66

基因67

基因68

基因69

基因70

基因71

基因72

G

基因73

基因74

基因75

基因76

基因77

基因78

基因79

基因80

基因81

基因82

基因83

基因84

H

HK1

HK2

HK3

GDC

GDC

GDC

RTC

RTC

RTC

PTC

PTC

PTC

 

& 基因引物:84个反应孔(从A排到G排)已预先交联好特异基因引物(详见基因引物列表)。

HK1-3:3条已交联的管家基因(内参)引物,可作为array数据标准化过程中样品的阳性对照。

&GDC:基因组DNA对照,可用于qPCR反应体系中是否有基因组DNA污染。

RTC:spike-in反转录对照,可用于检测RT反应的效率。这些已交联的引物可特异性扩增样品中外源性spike-in RNA反转录形成的cDNA模板。

PTC:阳性PCR对照,已交联DNA阳性质粒模板,主要用于实时监测array反应板的PCR扩增效率。

 

 

基因引物列表

 

A2020A0097M

PCR Array of Mouse Lung Cancer

序号

简称

货号

基因ID

基因1

Adam33

QMP110751

110751

基因2

Adrb2

tnt6104a

11555

基因3

Alox5

tnt8624a

11689

基因4

Areg

QMP11839

11839

基因5

Arg1

tnt5381b

11846

基因6

Bcl6

tnt8654a

12053

基因7

Ccl11

tnt7331a

20292

基因8

Ccl12

tnt2492b

20293

基因9

Ccl17

tnt3258b

20295

基因10

Ccl22

tnt7330b

20299

基因11

Ccl24

tnt3260b

56221

基因12

Ccl4

tnt2440a

20303

基因13

Ccl5

tnt2441a

20304

基因14

Ccr3

tnt5345b

12771

基因15

Ccr4

tnt3156a

12773

基因16

Ccr8

tnt7076a

12776

基因17

Cd40lg

tnt3164b

21947

基因18

Chil1

tnt8152b

12654

基因19

Chia

QMP81600

81600

基因20

Clca1

QMP23844

23844

基因21

Cma1

tnt6293b

17228

基因22

Cpa3

QMP12873

12873

基因23

Crlf2

QMP57914

57914

基因24

Csf2

tnt5270b

12981

基因25

Csf3r

QMP12986

12986

基因26

Cysltr1

QMP58861

58861

基因27

Ear11

QMP93726

93726

基因28

Epx

tnt7227b

13861

基因29

Ets1

QMP23871

23871

基因30

Fcer1a

QMP14125

14125

基因31

Foxp3

tnt6107b

20371

基因32

Gata3

tnt1171b

14462

基因33

Ptgdr2

QMP14764

14764

基因34

Icos

tnt3147a

54167

基因35

Ifng

tnt5271c

15978

基因36

Ifngr2

tnt2962a

15980

基因37

Il10

tnt5288e

16153

基因38

Il12a

tnt5289a

16159

基因39

Il12b

tnt5290b

16160

基因40

Il13

tnt6465b

16163

基因41

Il13ra1

tnt6967b

16164

基因42

Il13ra2

tnt6973a

16165

基因43

Il17a

tnt5200b

16171

基因44

Il17rb

tnt3159a

50905

基因45

Il18

tnt6547d

16173

基因46

Il1rl1

tnt4848a

17082

基因47

Il21

tnt2431b

60505

基因48

Il25

tnt2298b

140806

基因49

Il2ra

tnt6201b

16184

基因50

Il3

tnt3153b

16187

基因51

Il33

tnt6482b

77125

基因52

Il3ra

QMP16188

16188

基因53

Il4

tnt5292a

16189

基因54

Il4ra

tnt2304a

16190

基因55

Il5

tnt5206b

16191

基因56

Il5ra

tnt7080b

16192

基因57

Il6

tnt5199d

16193

基因58

Il9

tnt3154c

16198

基因59

Itga4

tnt8318a

16401

基因60

Kit

tnt6600b

16590

基因61

Kitl

QMP17311

17311

基因62

Ltb4r

QMP16995

16995

基因63

Maf

tnt2972b

17132

基因64

Mmp9

tnt5377b

17395

基因65

Mrc1

tnt5349a

17533

基因66

Ms4a2

QMP14126

14126

基因67

Pdcd1

tnt3947c

18566

基因68

Pmch

QMP110312

110312

基因69

Postn

tnt5391b

50706

基因70

Pparg

tnt6146b

19016

基因71

Prg2

tnt9753a

19074

基因73

Rnase2

QMP13587

13587

基因74

Rorc

tnt6108b

19885

基因75

Satb1

QMP20230

20230

基因76

Spi1

QMP20375

20375

基因77

Stat4

tnt2468b

20849

基因78

Stat5a

tnt2469c

20850

基因79

Stat6

tnt5738b

20852

基因80

Tbx21

tnt6374a

57765

基因81

Tgfb1

tnt5340b

21803

基因82

Tnfrsf4

tnt8573a

22163

基因83

Tnfsf4

tnt8575b

22164

基因84

Tpsb2

tnt6292a

17229

基因85

Actb

tnt0409

11461

基因86

B2m

tnt2619b

12010

基因87

Hprt1

QMP15452

15452

基因88

Ldha

tnt5700b

16828

基因89

Rplp1

QMP56040

56040

 

1.     任何一台能够做QPCR的仪器据能够做PCRarray吗?

回答:基本上任意一台的QPCR 仪器都可以进行QPCR array的实验。

BioTNT根据仪器采用的96孔或者384孔板,分为以下5种板型(plate format

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900standard 96well),ViiA7standard 96well

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block)7900HTfast block),stepone plusViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCyclerMyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96DNA Engine opticonopticon 2Chromo4

请您在订购时提供您使用的QPCR 仪器,我们也可以为您确定plate format;如果您的仪器不在以上清单上,也可以邮件咨询我们,我们会有专业的技术人员为您确定相应的plate format

 

2. BioTNT PCR array的适用在哪里?

回答:适用现有的通路研究;

适用少样本或中等样本,多基因的QPCR 检测;

在低样本或中等样本的情况下,费用和时间远小于自行建立QPCR实验;

使用方便,操作简单,结果稳定性好;

 

3. BioTNT PCR array的优点是什么?

回答:灵敏度高,样本使用量低;

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因;

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一;

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环;

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 

4. QPCR 得到实验数据后,如何进行后续的结果分析?需要配套的仪器设备吗?

回答: 您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击分析工具,然后再点击:分析软件下载下载后进行分析。不需要特殊的分析仪器。

 

5.   BioTNT PCR array,如果自己使用,需要购买哪些配套产品?

回答:您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击相关产品;

建议除了您要使用的PCR array 产品之外,您应购买以下产品,对PCR array进行配套使用:

PCR array cDNA第一链合成试剂盒 A2010B0B03  
Real time 染料PCR PreMIX A2010A0112
建议使用高品质的抽提试剂盒,推荐型号为:

Qiagen RNeasy Mini Kit (50) 74104
RNase-Free DNase Set (50)79254 

 

6. 如果使用其他公司的抽提试剂盒,如Trizol 法抽提试剂盒,能否使用BioTNTPCR array产品?

回答:建议抽提时尽量使用高质量的样本,高质量的抽提试剂盒,并在抽提时进行DNA 去除;使用PCR array 产品前,先进行样本质量的验证。能够通过样本质量验证的样本,可以进行PCR array实验。

 

7. 如何进行PCR array 实验前的样本质量验证?

回答:为了保证PCR array实验的质量,建议在使用前先进行样本质量验证;

RNA 定量与质量控制

A.  使用无菌水(RNase-free)稀释 RNA 样本,检测 260  nm  280  nm 吸光值,A260/280 应大于 1.8

B.  使用公式A260× 40 ×稀释倍数  = XXXXμg/mL 计算 RNA 浓度。

C.  使用琼脂糖凝胶电泳检测 RNA 完整性。

D.  建议:RNA 质量测定后,逆转录得到CDNA,建议用多个内参基因自行验证CDNA 质量;

推荐购买biotnt 的样本质量验证引物套装,可以在进行QPCR 之前对样本进行验证(包含内参引物,如human beta actin GAPDH,  18sRNA)

E.  基因组DNA污染控制

每个Array板块上的GDC(Genomic  DNA  Control)反应孔专为检测每个样品进行qPCR反应时可能存在的基因组DNA污染而设置。如果该反应孔的CT值小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。因此,必须从RNA样品中去除基因组和其他全部残余污染物。建议采用Qiagen 柱式抽提过程中加入DNAse去除基因组污染。

建议在进行PCR array 之前购买BioTNT 样本质量验证引物套装或者单独的GDC 引物进行基因组DNA 污染控制的质量验证;验证结果CT 值如果小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。

 

8. 如何进行样本的调平?

回答:进行PCR array之前,对样本需要进行调平。具体调平方式为:  

1.     RNA 含量调平:实验样本的RNA 尽量调到同一水平;加入RNA free的水,调整RNA浓度;

2.   调平后的样本:通过内参引物进行验证,根据CT 值,进行二次调平。

 

9. BioTNT PCR array定制费用如何?

回答:目前BioTNT PCR array 提供您的定制,仅比预制产品增加了400/板的定制费用。您可以把您要检测的指标给我们,然后把您的仪器型号,以及sample 数量,重复数量提供给我们,我们为您设置相应的PCR array 形式,并核算相应的费用给您。

BioTNT PCR array的定制,方式灵活,1 plate起订。

详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击定制服务

 

10.        如果我没有QPCR 仪器,BioTNT 能够提供什么服务?

回答:您可以选择BioTNT PCR array service

     详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击service

 

 

 

 

产品咨询:sales@biotnt.com    BioTNT订阅号:
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