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BioTNT PCR ARRAY of Human MAP Kinase Signaling P…
    产品中心    >>  试剂    >>  BioTNT核酸PCR相关    >>  PCR Array 关   闭
PCR ARRAY of Human MAP Kinase Signaling Pathway-MAP激酶信号通路系列
分类:PCR Array
品牌:BioTNT
货号:A2020A0101H/S
原价:2080
现价:¥1602.00    节省:¥478
特异性种属:human
规格:96孔*2板
产品参数

一、产品介绍:


PCR Array

 

 

BioTNT qPCR Array专为检测不同组织或细胞中特定基因的表达量而设计,这些基因按照预制或定制要求成套设置。检测结果所显示的表达差异可帮助研究者鉴定或验证这些基因的生物学意义,以及与其研究的重要相关性。

对于目录(预制)产品,每块384孔板包含84对PCR引物,可以进行4个样本单孔或者两个样本双复的实验。这些引物全部经过预先验证,并包被于指定的板孔中。在同一块96孔板上,有12个(384孔板有48个)反应孔包被了不同类型的对照,用以检测从反转录到qPCR整个过程的反应效率。

逆转录试剂和以荧光染料SYBR?Green 为基础的定量检测试剂作为被推荐的RT-qPCR试剂产品可与qPCR Array配套使用。该系列试剂均经过优化,具有高的灵敏度、效率和特异性。其他公司的类似试剂可能适用,但未验证过,不推荐使用。

 

产品优势


BioTNT QPCR芯片特点:

灵敏度高,样本使用量低

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 

产品说明

 

    The Human MAP Kinase Signaling Pathway   PCR Array profiles the expression of 84 genes related to the MAP kinase (MAPK) signaling pathway. Members of the MKKK, MKK, and MAPK families are represented on this array. Transcription factors and genes whose expression is induced by MAP kinase signaling are included as well. Raf regulating proteins and MEKK1 interacting proteins are found on this array along with cell cycle proteins regulated by the Erk1/2 pathway. Genes related to scaffolding and anchoring are also included. Using real-time PCR, you can easily and reliably analyze expression of a focused panel of genes related to the MAPK signaling pathway with this array.

 

 

二.运输和储存条件:


4度运输。

-20°C储存至少6个月;

 

 

三.适用仪器:


lifetechnoliges(原ABI) 7900, Viaa 7 等可使用384微孔板的QPCR 仪器。

也可以定制其他机器形式:

Biotnt 可提供多种与以下qPCR仪器匹配的qPCR array类型。

重要提示:在订购前,请根据您的qPCR仪器型号选购合适的array类型;在收到产品后,请及时确认收到的array是否与您的qPCR仪器匹配。如果您的仪器类型不在下表所列类型中,请及时联系本公司技术支持咨询。

 

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900,ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900(standard 96well),ViiA7(standard 96well)

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block),7900HT(fast block),stepone plus,ViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCycler,MyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96,DNA Engine opticon,opticon 2,Chromo4

 

四.质量标准(QC


1. biotnt gene qPCR array中检测的基因引物,经实验验证结果分析,融解曲线均呈单一锐锋,电泳条带均呈单一条带,说明这些引物均是特异扩增引物,验证合格。

2. PTC(阳性对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于18~22之间。

3. RTC(spike-in反转录对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于17~23之间。

4. HGDC 的CT 值应大于35,说明样本中没有基因组污染。

5. RTC和 PTC的三重复CT 值应比较接近,说明实验重复性好。

6. 板与板之间(批内)重复性达0.99以上,具有高度重复性。

 

 

五.基因(引物)排布 :

每一个样本区里的基因排列如下:

 

 

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

基因1

基因2

基因3

基因4

基因5

基因6

基因7

基因8

基因9

基因10

基因11

基因12

B

基因13

基因14

基因15

基因16

基因17

基因18

基因19

基因20

基因21

基因22

基因23

基因24

C

基因25

基因26

基因27

基因28

基因29

基因30

基因31

基因32

基因33

基因34

基因35

基因36

D

基因37

基因38

基因39

基因40

基因41

基因42

基因43

基因44

基因45

基因46

基因47

基因48

E

基因49

基因50

基因51

基因52

基因53

基因54

基因55

基因56

基因57

基因58

基因59

基因60

F

基因61

基因62

基因63

基因64

基因65

基因66

基因67

基因68

基因69

基因70

基因71

基因72

G

基因73

基因74

基因75

基因76

基因77

基因78

基因79

基因80

基因81

基因82

基因83

基因84

H

HK1

HK2

HK3

GDC

GDC

GDC

RTC

RTC

RTC

PTC

PTC

PTC

 

& 基因引物:84个反应孔(从A排到G排)已预先交联好特异基因引物(详见基因引物列表)。

HK1-3:3条已交联的管家基因(内参)引物,可作为array数据标准化过程中样品的阳性对照。

&GDC:基因组DNA对照,可用于qPCR反应体系中是否有基因组DNA污染。

RTC:spike-in反转录对照,可用于检测RT反应的效率。这些已交联的引物可特异性扩增样品中外源性spike-in RNA反转录形成的cDNA模板。

PTC:阳性PCR对照,已交联DNA阳性质粒模板,主要用于实时监测array反应板的PCR扩增效率。

 

基因引物列表

A2020A0101H

PCR ARRAY of Human MAP Kinase Signaling Pathway

序号

简称

货号

基因ID

基因1

ARAF

QHP369

369

基因2

ATF2

QHP1386

1386

基因3

BRAF

tnt4873a

673

基因4

CCNA1

tnt5729b

8900

基因5

CCNA2

tnt5479a

890

基因6

CCNB1

tnt6601b

891

基因7

CCNB2

tnt3585a

9133

基因8

CCND1

tnt5368b

595

基因9

CCND2

tnt3365a

894

基因10

CCND3

tnth10008a

896

基因11

CCNE1

tnt5325a

898

基因12

CDC42

tnt6767a

998

基因13

CDK2

tnt5324c

1017

基因14

CDK4

tnt3287a

1019

基因15

CDK6

tnt1093b

1021

基因16

CDKN1A(p21CIP1/WAF1)

QHP1026

1026

基因17

CDKN1B

tnt2227a

1027

基因18

CDKN1C

tnt2229a

1028

基因19

CDKN2A

tnt2225a

1029

基因20

CDKN2B

tnt5475b

1030

基因21

CDKN2C

tnt2226a

1031

基因22

CDKN2D

QHP1032

1032

基因23

CHUK

tnt2715a

1147

基因24

COL1A1

tnt5567b

1277

基因25

CREB1

tnt4510b

1385

基因26

CREBBP

tnt3476a

1387

基因27

DLK1

tnt4215a

8788

基因28

E2F1

tnt2221b

1869

基因29

EGFR

tnt7334b

1956

基因30

EGR1

tnt9097a

1958

基因31

ELK1

tnt2916b

2002

基因32

ETS1

QHP2113

2113

基因33

ETS2

tnt4195b

2114

基因34

FOS

tnt6582a

2353

基因35

GRB2

tnt8861a

2885

基因36

HRAS

tnt1900a

3265

基因37

HSPA5

tnt1403b

3309

基因38

HSPB1

tnth2937c

3315

基因39

JUN

tnt3244b

3725

基因40

KRAS

tnt2678a

3845

基因41

KSR1

QHP8844

8844

基因42

LAMTOR3

QHP8649

8649

基因43

MAP2K1

tnt2943b

5604

基因44

MAP2K2

tnt2944b

5605

基因45

MAP2K3

tnt4201a

5606

基因46

MAP2K4

tnt2728b

6416

基因47

MAP2K5

tnt6035b

5607

基因48

MAP2K6

tnt5793b

5608

基因49

MAP2K7

QHP5609

5609

基因50

MAP3K1

tnt2679b

4214

基因51

MAP3K2

QHP10746

10746

基因52

MAP3K3

QHP4215

4215

基因53

MAP3K4

QHP4216

4216

基因54

MAP4K1

QHP11184

11184

基因55

MAPK1

tnt5900b

5594

基因56

MAPK10

tnt3243a

5602

基因57

MAPK11

QHP5600

5600

基因58

MAPK12

tnt3080a

6300

基因59

MAPK13

tnt8295a

5603

基因60

MAPK14

tnt3286b

1432

基因61

MAPK3

tnt3285b

5595

基因62

MAPK6

QHP5597

5597

基因63

MAPK7

tnt2921b

5598

基因64

MAPK8

tnt2354b

5599

基因65

MAPK8IP2

QHP23542

23542

基因66

MAPK9

tnt3242a

5601

基因67

MAPKAPK2

QHP9261

9261

基因68

MAPKAPK3

QHP7867

7867

基因69

MAX

QHP4149

4149

基因70

MEF2C

tnt5954b

4208

基因71

MKNK1

QHP8569

8569

基因72

MOS

QHP4342

4342

基因73

MST1

QHP4485

4485

基因74

MYC

tnt5255b

4609

基因75

NFATC4

tnth10321a

4776

基因76

NRAS

QHP4893

4893

基因77

PAK1

tnth10106a

5058

基因78

PRDX6

tnt3228a

9588

基因79

RAC1

tnt2918b

5879

基因80

RAF1

tnt1899b

5894

基因81

RB1

tnt2246a

5925

基因82

SFN

tnt7491b

2810

基因83

SMAD4

tnt5259b

4089

基因84

TP53

tnt5980b

7157

 

 

1.     任何一台能够做QPCR的仪器据能够做PCRarray吗?

回答:基本上任意一台的QPCR 仪器都可以进行QPCR array的实验。

BioTNT根据仪器采用的96孔或者384孔板,分为以下5种板型(plate format

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900standard 96well),ViiA7standard 96well

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block)7900HTfast block),stepone plusViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCyclerMyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96DNA Engine opticonopticon 2Chromo4

请您在订购时提供您使用的QPCR 仪器,我们也可以为您确定plate format;如果您的仪器不在以上清单上,也可以邮件咨询我们,我们会有专业的技术人员为您确定相应的plate format

 

2. BioTNT PCR array的适用在哪里?

回答:适用现有的通路研究;

适用少样本或中等样本,多基因的QPCR 检测;

在低样本或中等样本的情况下,费用和时间远小于自行建立QPCR实验;

使用方便,操作简单,结果稳定性好;

 

3. BioTNT PCR array的优点是什么?

回答:灵敏度高,样本使用量低;

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因;

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一;

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环;

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 

4. QPCR 得到实验数据后,如何进行后续的结果分析?需要配套的仪器设备吗?

回答: 您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击分析工具,然后再点击:分析软件下载下载后进行分析。不需要特殊的分析仪器。

 

5.   BioTNT PCR array,如果自己使用,需要购买哪些配套产品?

回答:您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击相关产品;

建议除了您要使用的PCR array 产品之外,您应购买以下产品,对PCR array进行配套使用:

PCR array cDNA第一链合成试剂盒 A2010B0B03  
Real time 染料PCR PreMIX A2010A0112
建议使用高品质的抽提试剂盒,推荐型号为:

Qiagen RNeasy Mini Kit (50) 74104
RNase-Free DNase Set (50)79254 

 

6. 如果使用其他公司的抽提试剂盒,如Trizol 法抽提试剂盒,能否使用BioTNTPCR array产品?

回答:建议抽提时尽量使用高质量的样本,高质量的抽提试剂盒,并在抽提时进行DNA 去除;使用PCR array 产品前,先进行样本质量的验证。能够通过样本质量验证的样本,可以进行PCR array实验。

 

7. 如何进行PCR array 实验前的样本质量验证?

回答:为了保证PCR array实验的质量,建议在使用前先进行样本质量验证;

RNA 定量与质量控制

A.  使用无菌水(RNase-free)稀释 RNA 样本,检测 260  nm  280  nm 吸光值,A260/280 应大于 1.8

B.  使用公式A260× 40 ×稀释倍数  = XXXXμg/mL 计算 RNA 浓度。

C.  使用琼脂糖凝胶电泳检测 RNA 完整性。

D.  建议:RNA 质量测定后,逆转录得到CDNA,建议用多个内参基因自行验证CDNA 质量;

推荐购买biotnt 的样本质量验证引物套装,可以在进行QPCR 之前对样本进行验证(包含内参引物,如human beta actin GAPDH,  18sRNA)

E.  基因组DNA污染控制

每个Array板块上的GDC(Genomic  DNA  Control)反应孔专为检测每个样品进行qPCR反应时可能存在的基因组DNA污染而设置。如果该反应孔的CT值小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。因此,必须从RNA样品中去除基因组和其他全部残余污染物。建议采用Qiagen 柱式抽提过程中加入DNAse去除基因组污染。

建议在进行PCR array 之前购买BioTNT 样本质量验证引物套装或者单独的GDC 引物进行基因组DNA 污染控制的质量验证;验证结果CT 值如果小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。

 

8. 如何进行样本的调平?

回答:进行PCR array之前,对样本需要进行调平。具体调平方式为:  

1.     RNA 含量调平:实验样本的RNA 尽量调到同一水平;加入RNA free的水,调整RNA浓度;

2.   调平后的样本:通过内参引物进行验证,根据CT 值,进行二次调平。

 

9. BioTNT PCR array定制费用如何?

回答:目前BioTNT PCR array 提供您的定制,仅比预制产品增加了400/板的定制费用。您可以把您要检测的指标给我们,然后把您的仪器型号,以及sample 数量,重复数量提供给我们,我们为您设置相应的PCR array 形式,并核算相应的费用给您。

BioTNT PCR array的定制,方式灵活,1 plate起订。

详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击定制服务

 

10.        如果我没有QPCR 仪器,BioTNT 能够提供什么服务?

回答:您可以选择BioTNT PCR array service

     详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击service

 

 

 

 

产品咨询:sales@biotnt.com    BioTNT订阅号:
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