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BioTNT PCR ARRAY of Mouse Necrosis-坏疽系列
    产品中心    >>  试剂    >>  BioTNT核酸PCR相关    >>  PCR Array 关   闭
PCR ARRAY of Mouse Necrosis-坏疽系列
分类:PCR Array
品牌:BioTNT
货号:A2020A0109M/S
原价:2083
现价:¥1602.00    节省:¥481
特异性种属:mouse
规格:96孔*2板
产品参数

一、产品介绍:


PCR Array

 

 

BioTNT qPCR Array专为检测不同组织或细胞中特定基因的表达量而设计,这些基因按照预制或定制要求成套设置。检测结果所显示的表达差异可帮助研究者鉴定或验证这些基因的生物学意义,以及与其研究的重要相关性。

对于目录(预制)产品,每块384孔板包含84对PCR引物,可以进行4个样本单孔或者两个样本双复的实验。这些引物全部经过预先验证,并包被于指定的板孔中。在同一块96孔板上,有12个(384孔板有48个)反应孔包被了不同类型的对照,用以检测从反转录到qPCR整个过程的反应效率。

逆转录试剂和以荧光染料SYBR?Green 为基础的定量检测试剂作为被推荐的RT-qPCR试剂产品可与qPCR Array配套使用。该系列试剂均经过优化,具有高的灵敏度、效率和特异性。其他公司的类似试剂可能适用,但未验证过,不推荐使用。

 

产品优势


BioTNT QPCR芯片特点:

灵敏度高,样本使用量低

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 


产品说明

   

Mouse Necrosis PCR Array 

The Mouse Necrosis   PCR Array profiles the expression of 84 key genes central to necrotic cell death. Historically considered an accidental or uncontrolled cell death via swelling and lysis, necrosis (also known as necroptosis, programmed necrosis, oncosis, or type III cell death) has been found by recent scientific studies to act like a specific controlled cellular program. Activated death receptors (FAS, TNFRSF1A (TNFR1), and TNFRSF10A (TRAIL-R)) signal through the serine/threonine kinase RIPK1 (RIP1). RIPK1 interacts with RIPK3 and activates PARP1 leading to mitochondrial effects such as increased reactive oxygen species (ROS), increased cytosolic calcium, and ATP depletion. This array includes genes involved in programmed necrosis, potential necrotic genes downstream of key necrotic activators, genes involved in death receptor signaling, and genes involved in ROS production or mitochondrial activity. The same death receptors initiate both necrotic signaling and apoptosis; therefore, this array also represents downstream effectors shared by these cell death programs. Results obtained using this array can yield new insights into the molecular mechanisms of necrotic cell death. Using real-time PCR, research studies can easily and reliably analyze the expression of a focused panel of genes involved in programmed necrosis with this array.

The   PCR Arrays are intended for molecular biology applications. This product is not intended for the diagnosis, prevention, or treatment of a disease.

 

 

 

二.运输和储存条件:


4度运输。

-20°C储存至少6个月;

 

 

三.适用仪器:


lifetechnoliges(原ABI) 7900, Viaa 7 等可使用384微孔板的QPCR 仪器。

也可以定制其他机器形式:

Biotnt 可提供多种与以下qPCR仪器匹配的qPCR array类型。

重要提示:在订购前,请根据您的qPCR仪器型号选购合适的array类型;在收到产品后,请及时确认收到的array是否与您的qPCR仪器匹配。如果您的仪器类型不在下表所列类型中,请及时联系本公司技术支持咨询。

 

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900,ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900(standard 96well),ViiA7(standard 96well)

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block),7900HT(fast block),stepone plus,ViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCycler,MyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96,DNA Engine opticon,opticon 2,Chromo4

 

四.质量标准(QC


1. biotnt gene qPCR array中检测的基因引物,经实验验证结果分析,融解曲线均呈单一锐锋,电泳条带均呈单一条带,说明这些引物均是特异扩增引物,验证合格。

2. PTC(阳性对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于18~22之间。

3. RTC(spike-in反转录对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于17~23之间。

4. HGDC 的CT 值应大于35,说明样本中没有基因组污染。

5. RTC和 PTC的三重复CT 值应比较接近,说明实验重复性好。

6. 板与板之间(批内)重复性达0.99以上,具有高度重复性。

 

 

五.基因(引物)排布 :

每一个样本区里的基因排列如下:

 

 

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

基因1

基因2

基因3

基因4

基因5

基因6

基因7

基因8

基因9

基因10

基因11

基因12

B

基因13

基因14

基因15

基因16

基因17

基因18

基因19

基因20

基因21

基因22

基因23

基因24

C

基因25

基因26

基因27

基因28

基因29

基因30

基因31

基因32

基因33

基因34

基因35

基因36

D

基因37

基因38

基因39

基因40

基因41

基因42

基因43

基因44

基因45

基因46

基因47

基因48

E

基因49

基因50

基因51

基因52

基因53

基因54

基因55

基因56

基因57

基因58

基因59

基因60

F

基因61

基因62

基因63

基因64

基因65

基因66

基因67

基因68

基因69

基因70

基因71

基因72

G

基因73

基因74

基因75

基因76

基因77

基因78

基因79

基因80

基因81

基因82

基因83

基因84

H

HK1

HK2

HK3

GDC

GDC

GDC

RTC

RTC

RTC

PTC

PTC

PTC

 

& 基因引物:84个反应孔(从A排到G排)已预先交联好特异基因引物(详见基因引物列表)。

HK1-3:3条已交联的管家基因(内参)引物,可作为array数据标准化过程中样品的阳性对照。

&GDC:基因组DNA对照,可用于qPCR反应体系中是否有基因组DNA污染。

RTC:spike-in反转录对照,可用于检测RT反应的效率。这些已交联的引物可特异性扩增样品中外源性spike-in RNA反转录形成的cDNA模板。

PTC:阳性PCR对照,已交联DNA阳性质粒模板,主要用于实时监测array反应板的PCR扩增效率。

 

 

基因引物列表

 

A2020A0109M

PCR Array of Mouse Necrosis

序号

简称

货号

基因ID

基因1

Abca1

tnt6006a

11303

基因2

Ace

tnt7247b

11421

基因3

Apoa1

tnt7400b

11806

基因4

Apob

tnt5624b

238055

基因5

Apoe

tnt7705a

11816

基因6

Bax

tnt6383a

12028

基因7

Bcl2

tnt5412c

12043

基因8

Bcl2a1a

tnt5683b

12044

基因9

Bcl2l1

tnt2472b

12048

基因10

Bid

tnt5487a

12122

基因11

Birc3

tnt5684b

11796

基因12

Ccl2

tnt1466c

20296

基因13

Ccl5

tnt2441a

20304

基因14

Ccr1

tnt3853a

12768

基因15

Ccr2

tnt2303b

12772

基因16

Cd44

tnt5679a

12505

基因17

Cdh5

tnt1327

12562

基因18

Cflar

QMP12633

12633

基因19

Col3a1

tnt1163c

12825

基因20

Csf2

tnt5270b

12981

基因21

Ctgf

tnt2494b

14219

基因22

Cxcl1

tnt7789a

14825

基因23

Eln

tnt7843b

13717

基因24

Eng

tnt2499b

13805

基因25

Fabp3

tnt2107a

14077

基因26

Fas

tnt2473a

14102

基因27

Fga

QMP14161

14161

基因28

Fgb

QMP110135

110135

基因29

Fgf2

tnt2005a

14173

基因30

Fn1

tnt1681b

14268

基因31

Hbegf

tnt3761a

15200

基因32

Icam1

tnt3146a

15894

基因33

Ifng

tnt5271c

15978

基因34

Il1a

tnt5272c

16175

基因35

Il1b

tnt5198b

16176

基因36

Il1r1

tnt3158b

16177

基因37

Il1r2

tnt8801a

16178

基因38

Il2

tnt5291b

16183

基因39

Il3

tnt3153b

16187

基因40

Il4

tnt5292a

16189

基因41

Il5

tnt5206b

16191

基因42

Itga2

tnt9383a

16398

基因43

Itga5

tnt3083a

16402

基因44

Itgax

tnt4133c

16411

基因45

Itgb2

tnt2314a

16414

基因46

Kdr

tnt5451b

16542

基因47

Klf2

tnt2026a

16598

基因48

Lama1

QMP16772

16772

基因49

Ldlr

tnt6093b

16835

基因50

Lif

tnt3271b

16878

基因51

Lpl

tnt1991b

16956

基因52

Lypla1

QMP18777

18777

基因53

Mmp1a

QMP83995

83995

基因54

Mmp3

tnt6003b

17392

基因55

Msr1

QMP20288

20288

基因56

Nfkb1

tnt1122

18033

基因57

Npy

tnt8919a

109648

基因58

Nr1h3

tnt2043b

22259

基因59

Pdgfa

QMP18590

18590

基因60

Pdgfb

tnt1481b

18591

基因61

Pdgfrb

QMP18596

18596

基因62

Plin2

tnt4833a

11520

基因63

Ppara

tnt2035b

19013

基因64

Ppard

tnt7454b

19015

基因65

Pparg

tnt6146b

19016

基因66

Ptgs1

tnt2436a

19224

基因67

Rxra

tnt7349b

20181

基因68

Sele

tnt1340

20339

基因69

Sell

QMP20343

20343

基因70

Selp

tnt2639a

20344

基因71

Selplg

tnt9528a

20345

基因72

Serpinb2

QMP18788

18788

基因73

Serpine1

tnt1682b

18787

基因74

Sod1

tnt6927b

20655

基因75

Spp1

tnt5376b

20750

基因76

Tgfb1

tnt5340b

21803

基因77

Tgfb2

tnt2524a

21808

基因78

Thbs4

tnt8959a

21828

基因79

Tnc

tnt1652a

21923

基因80

Tnf

tnt5197e

21926

基因81

Tnfaip3

tnt4749b

21929

基因82

Vcam1

tnt6642b

22329

基因83

Vegfa

tnt5711b

22339

基因84

Vwf

tnt6130a

22371

 

1.     任何一台能够做QPCR的仪器据能够做PCRarray吗?

回答:基本上任意一台的QPCR 仪器都可以进行QPCR array的实验。

BioTNT根据仪器采用的96孔或者384孔板,分为以下5种板型(plate format

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900standard 96well),ViiA7standard 96well

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block)7900HTfast block),stepone plusViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCyclerMyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96DNA Engine opticonopticon 2Chromo4

请您在订购时提供您使用的QPCR 仪器,我们也可以为您确定plate format;如果您的仪器不在以上清单上,也可以邮件咨询我们,我们会有专业的技术人员为您确定相应的plate format

 

2. BioTNT PCR array的适用在哪里?

回答:适用现有的通路研究;

适用少样本或中等样本,多基因的QPCR 检测;

在低样本或中等样本的情况下,费用和时间远小于自行建立QPCR实验;

使用方便,操作简单,结果稳定性好;

 

3. BioTNT PCR array的优点是什么?

回答:灵敏度高,样本使用量低;

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因;

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一;

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环;

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 

4. QPCR 得到实验数据后,如何进行后续的结果分析?需要配套的仪器设备吗?

回答: 您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击分析工具,然后再点击:分析软件下载下载后进行分析。不需要特殊的分析仪器。

 

5.   BioTNT PCR array,如果自己使用,需要购买哪些配套产品?

回答:您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击相关产品;

建议除了您要使用的PCR array 产品之外,您应购买以下产品,对PCR array进行配套使用:

PCR array cDNA第一链合成试剂盒 A2010B0B03  
Real time 染料PCR PreMIX A2010A0112
建议使用高品质的抽提试剂盒,推荐型号为:

Qiagen RNeasy Mini Kit (50) 74104
RNase-Free DNase Set (50)79254 

 

6. 如果使用其他公司的抽提试剂盒,如Trizol 法抽提试剂盒,能否使用BioTNTPCR array产品?

回答:建议抽提时尽量使用高质量的样本,高质量的抽提试剂盒,并在抽提时进行DNA 去除;使用PCR array 产品前,先进行样本质量的验证。能够通过样本质量验证的样本,可以进行PCR array实验。

 

7. 如何进行PCR array 实验前的样本质量验证?

回答:为了保证PCR array实验的质量,建议在使用前先进行样本质量验证;

RNA 定量与质量控制

A.  使用无菌水(RNase-free)稀释 RNA 样本,检测 260  nm  280  nm 吸光值,A260/280 应大于 1.8

B.  使用公式A260× 40 ×稀释倍数  = XXXXμg/mL 计算 RNA 浓度。

C.  使用琼脂糖凝胶电泳检测 RNA 完整性。

D.  建议:RNA 质量测定后,逆转录得到CDNA,建议用多个内参基因自行验证CDNA 质量;

推荐购买biotnt 的样本质量验证引物套装,可以在进行QPCR 之前对样本进行验证(包含内参引物,如human beta actin GAPDH,  18sRNA)

E.  基因组DNA污染控制

每个Array板块上的GDC(Genomic  DNA  Control)反应孔专为检测每个样品进行qPCR反应时可能存在的基因组DNA污染而设置。如果该反应孔的CT值小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。因此,必须从RNA样品中去除基因组和其他全部残余污染物。建议采用Qiagen 柱式抽提过程中加入DNAse去除基因组污染。

建议在进行PCR array 之前购买BioTNT 样本质量验证引物套装或者单独的GDC 引物进行基因组DNA 污染控制的质量验证;验证结果CT 值如果小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。

 

8. 如何进行样本的调平?

回答:进行PCR array之前,对样本需要进行调平。具体调平方式为:  

1.     RNA 含量调平:实验样本的RNA 尽量调到同一水平;加入RNA free的水,调整RNA浓度;

2.   调平后的样本:通过内参引物进行验证,根据CT 值,进行二次调平。

 

9. BioTNT PCR array定制费用如何?

回答:目前BioTNT PCR array 提供您的定制,仅比预制产品增加了400/板的定制费用。您可以把您要检测的指标给我们,然后把您的仪器型号,以及sample 数量,重复数量提供给我们,我们为您设置相应的PCR array 形式,并核算相应的费用给您。

BioTNT PCR array的定制,方式灵活,1 plate起订。

详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击定制服务

 

10.        如果我没有QPCR 仪器,BioTNT 能够提供什么服务?

回答:您可以选择BioTNT PCR array service

     详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击service

 

 

 

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