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BioTNT PCR ARRAY of Mouse Parkinson´s Dise…
    产品中心    >>  试剂    >>  BioTNT核酸PCR相关    >>  PCR Array 关   闭
PCR ARRAY of Mouse Parkinson´s Disease-帕金森氏病系列
分类:PCR Array
品牌:BioTNT
货号:A2020A0131M/S
原价:2083
现价:¥1602.00    节省:¥481
特异性种属:mouse
规格:96孔*2板
产品参数

一、产品介绍:


PCR Array

 

 

BioTNT qPCR Array专为检测不同组织或细胞中特定基因的表达量而设计,这些基因按照预制或定制要求成套设置。检测结果所显示的表达差异可帮助研究者鉴定或验证这些基因的生物学意义,以及与其研究的重要相关性。

对于目录(预制)产品,每块384孔板包含84对PCR引物,可以进行4个样本单孔或者两个样本双复的实验。这些引物全部经过预先验证,并包被于指定的板孔中。在同一块96孔板上,有12个(384孔板有48个)反应孔包被了不同类型的对照,用以检测从反转录到qPCR整个过程的反应效率。

逆转录试剂和以荧光染料SYBR?Green 为基础的定量检测试剂作为被推荐的RT-qPCR试剂产品可与qPCR Array配套使用。该系列试剂均经过优化,具有高的灵敏度、效率和特异性。其他公司的类似试剂可能适用,但未验证过,不推荐使用。

 

产品优势


BioTNT QPCR芯片特点:

灵敏度高,样本使用量低

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 


产品说明


The Mouse Parkinson's Disease RT2 Profiler? PCR Array profiles the expression of 84 key genes directly or potentially involved in Parkinson's disease (PD). PD is a neurodegenerative disorder caused by loss of dopaminergic neurons. Although there are inheritable genetic forms of PD, the majority of diagnoses are sporadic PD, where the cause is unknown. Gene expression microarray analyses of multiple PD animal models have shed insight into the mechanism of PD initiation and progression. For example, one microarray study shows that genes of the PARK family, central to inheritable PD, are also dysregulated in patients diagnosed with sporadic PD. In addition, this study identifies dysregulated genes involved in ion transport, such as ATP2B2. Therefore, PD research focuses on both known mutated genes, such as Alpha-synuclein (SNCA) and Parkin (PARK2), as well as novel genes identified from microarray experiments. This array includes known PD genes and their interactors, as well as genes whose expression changes across multiple human, mouse, rat and macaque PD microarray analyses. These genes mediate multiple cellular functions dysregulated in PD, such as ubiquitination, ion transport, apoptosis and dopaminergic signaling. Using real-time PCR, you can easily and reliably analyze the expression of a focused panel of genes involved in Parkinson's disease progression with this array.

 

 

 

二.运输和储存条件:


4度运输。

-20°C储存至少6个月;

 

 

三.适用仪器:


lifetechnoliges(原ABI) 7900, Viaa 7 等可使用384微孔板的QPCR 仪器。

也可以定制其他机器形式:

Biotnt 可提供多种与以下qPCR仪器匹配的qPCR array类型。

重要提示:在订购前,请根据您的qPCR仪器型号选购合适的array类型;在收到产品后,请及时确认收到的array是否与您的qPCR仪器匹配。如果您的仪器类型不在下表所列类型中,请及时联系本公司技术支持咨询。

 

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900,ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900(standard 96well),ViiA7(standard 96well)

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block),7900HT(fast block),stepone plus,ViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCycler,MyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96,DNA Engine opticon,opticon 2,Chromo4

 

四.质量标准(QC


1. biotnt gene qPCR array中检测的基因引物,经实验验证结果分析,融解曲线均呈单一锐锋,电泳条带均呈单一条带,说明这些引物均是特异扩增引物,验证合格。

2. PTC(阳性对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于18~22之间。

3. RTC(spike-in反转录对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于17~23之间。

4. HGDC 的CT 值应大于35,说明样本中没有基因组污染。

5. RTC和 PTC的三重复CT 值应比较接近,说明实验重复性好。

6. 板与板之间(批内)重复性达0.99以上,具有高度重复性。

 

 

五.基因(引物)排布 :

每一个样本区里的基因排列如下:

 

 

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

基因1

基因2

基因3

基因4

基因5

基因6

基因7

基因8

基因9

基因10

基因11

基因12

B

基因13

基因14

基因15

基因16

基因17

基因18

基因19

基因20

基因21

基因22

基因23

基因24

C

基因25

基因26

基因27

基因28

基因29

基因30

基因31

基因32

基因33

基因34

基因35

基因36

D

基因37

基因38

基因39

基因40

基因41

基因42

基因43

基因44

基因45

基因46

基因47

基因48

E

基因49

基因50

基因51

基因52

基因53

基因54

基因55

基因56

基因57

基因58

基因59

基因60

F

基因61

基因62

基因63

基因64

基因65

基因66

基因67

基因68

基因69

基因70

基因71

基因72

G

基因73

基因74

基因75

基因76

基因77

基因78

基因79

基因80

基因81

基因82

基因83

基因84

H

HK1

HK2

HK3

GDC

GDC

GDC

RTC

RTC

RTC

PTC

PTC

PTC

 

& 基因引物:84个反应孔(从A排到G排)已预先交联好特异基因引物(详见基因引物列表)。

HK1-3:3条已交联的管家基因(内参)引物,可作为array数据标准化过程中样品的阳性对照。

&GDC:基因组DNA对照,可用于qPCR反应体系中是否有基因组DNA污染。

RTC:spike-in反转录对照,可用于检测RT反应的效率。这些已交联的引物可特异性扩增样品中外源性spike-in RNA反转录形成的cDNA模板。

PTC:阳性PCR对照,已交联DNA阳性质粒模板,主要用于实时监测array反应板的PCR扩增效率。

 

 

基因信息列表

A2020A0131M

PCR Array of Mouse Parkinson's Disease

序号

简称

货号

基因ID

基因1

Aanat

QMP11298

11298

基因2

Alas1

QMP11655

11655

基因3

Arntl

tnt7826a

11865

基因4

Arntl2

QMP272322

272322

基因5

Bhlhe40

QMP20893

20893

基因6

Bhlhe41

QMP79362

79362

基因7

Camk2a

tnt3537a

12322

基因8

Camk2b

QMP12323

12323

基因9

Camk2d

QMP108058

108058

基因10

Camk2g

QMP12325

12325

基因11

Cartpt

QMP27220

27220

基因12

Ccrn4l

QMP12457

12457

基因13

Chrnb2

QMP11444

11444

基因14

Clock

tnt7825a

12753

基因15

Creb1

tnt1124b

12912

基因16

Creb3

QMP12913

12913

基因17

Crx

QMP12951

12951

基因18

Cry1

tnt7823b

12952

基因19

Cry2

tnt7824b

12953

基因20

Csnk1a1

QMP93687

93687

基因21

Csnk1d

tnt8232b

104318

基因22

Csnk1e

tnt8233a

27373

基因23

Csnk2a1

QMP12995

12995

基因24

Csnk2a2

QMP13000

13000

基因25

Dbp

tnt7352b

13170

基因26

Egr1

tnt8168b

13653

基因27

Egr3

tnt6042b

13655

基因28

Epo

tnt5688b

13856

基因29

Esrra

tnt7785b

26379

基因30

Fbxl21

QMP213311

213311

基因31

Fbxl3

QMP50789

50789

基因32

Hebp1

QMP15199

15199

基因33

Hlf

QMP217082

217082

基因34

Htr7

QMP15566

15566

基因35

Irf1

tnt2474b

16362

基因36

Kcnma1

QMP16531

16531

基因37

Mapk1

tnt7063a

26413

基因38

Mapk14

tnt4111b

26416

基因39

Mapk3

tnt6441a

26417

基因40

Mat2a

QMP232087

232087

基因41

Mtnr1a

QMP17773

17773

基因42

Mtnr1b

QMP244701

244701

基因43

Myod1

tnt5471c

17927

基因44

Ncoa3

QMP17979

17979

基因45

Nfil3

QMP18030

18030

基因46

Nkx2-5

tnt6097b

18091

基因47

Nms

QMP433292

433292

基因48

Npas2

tnt7827b

18143

基因49

Nr1d1

tnt7828a

217166

基因50

Nr1d2

QMP353187

353187

基因51

Nr2f6

QMP13864

13864

基因52

Opn3

tnt8736a

13603

基因53

Opn4

QMP30044

30044

基因54

Pax4

QMP18506

18506

基因55

Per1

tnt7820b

18626

基因56

Per2

tnt7821b

18627

基因57

Per3

tnt7822a

18628

基因58

Pou2f1

QMP18986

18986

基因59

Ppara

tnt2035b

19013

基因60

Ppargc1a

tnt6239b

19017

基因61

Prf1

tnt8106b

18646

基因62

Prkaca

tnt2120a

18747

基因63

Prkacb

tnt7426a

18749

基因64

Prkar1a

QMP19084

19084

基因65

Prkar1b

QMP19085

19085

基因66

Prkar2a

QMP19087

19087

基因67

Prkar2b

tnt7660a

19088

基因68

Prkca

tnt6396b

18750

基因69

Prkcb

QMP18751

18751

基因70

Prokr2

QMP246313

246313

基因71

Ptgds

tnt1117

19215

基因72

Rora

tnt7536b

19883

基因73

Rorb

tnt9580a

225998

基因74

Rorc

tnt6108b

19885

基因75

Slc9a3

tnt7344b

105243

基因76

Smad4

tnt6447a

17128

基因77

Sp1

QMP20683

20683

基因78

Srebf1

tnt5369b

20787

基因79

Stat5a

tnt2469c

20850

基因80

Tfap2a

QMP21418

21418

基因81

Tef

QMP21685

21685

基因82

Tgfb1

tnt5340b

21803

基因83

Timeless

tnt9581a

21853

基因84

Wee1

tnt2900a

22390

 

 

1.     任何一台能够做QPCR的仪器据能够做PCRarray吗?

回答:基本上任意一台的QPCR 仪器都可以进行QPCR array的实验。

BioTNT根据仪器采用的96孔或者384孔板,分为以下5种板型(plate format

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900standard 96well),ViiA7standard 96well

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block)7900HTfast block),stepone plusViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCyclerMyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96DNA Engine opticonopticon 2Chromo4

请您在订购时提供您使用的QPCR 仪器,我们也可以为您确定plate format;如果您的仪器不在以上清单上,也可以邮件咨询我们,我们会有专业的技术人员为您确定相应的plate format

 

2. BioTNT PCR array的适用在哪里?

回答:适用现有的通路研究;

适用少样本或中等样本,多基因的QPCR 检测;

在低样本或中等样本的情况下,费用和时间远小于自行建立QPCR实验;

使用方便,操作简单,结果稳定性好;

 

3. BioTNT PCR array的优点是什么?

回答:灵敏度高,样本使用量低;

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因;

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一;

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环;

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 

4. QPCR 得到实验数据后,如何进行后续的结果分析?需要配套的仪器设备吗?

回答: 您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击分析工具,然后再点击:分析软件下载下载后进行分析。不需要特殊的分析仪器。

 

5.   BioTNT PCR array,如果自己使用,需要购买哪些配套产品?

回答:您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击相关产品;

建议除了您要使用的PCR array 产品之外,您应购买以下产品,对PCR array进行配套使用:

PCR array cDNA第一链合成试剂盒 A2010B0B03  
Real time 染料PCR PreMIX A2010A0112
建议使用高品质的抽提试剂盒,推荐型号为:

Qiagen RNeasy Mini Kit (50) 74104
RNase-Free DNase Set (50)79254 

 

6. 如果使用其他公司的抽提试剂盒,如Trizol 法抽提试剂盒,能否使用BioTNTPCR array产品?

回答:建议抽提时尽量使用高质量的样本,高质量的抽提试剂盒,并在抽提时进行DNA 去除;使用PCR array 产品前,先进行样本质量的验证。能够通过样本质量验证的样本,可以进行PCR array实验。

 

7. 如何进行PCR array 实验前的样本质量验证?

回答:为了保证PCR array实验的质量,建议在使用前先进行样本质量验证;

RNA 定量与质量控制

A.  使用无菌水(RNase-free)稀释 RNA 样本,检测 260  nm  280  nm 吸光值,A260/280 应大于 1.8

B.  使用公式A260× 40 ×稀释倍数  = XXXXμg/mL 计算 RNA 浓度。

C.  使用琼脂糖凝胶电泳检测 RNA 完整性。

D.  建议:RNA 质量测定后,逆转录得到CDNA,建议用多个内参基因自行验证CDNA 质量;

推荐购买biotnt 的样本质量验证引物套装,可以在进行QPCR 之前对样本进行验证(包含内参引物,如human beta actin GAPDH,  18sRNA)

E.  基因组DNA污染控制

每个Array板块上的GDC(Genomic  DNA  Control)反应孔专为检测每个样品进行qPCR反应时可能存在的基因组DNA污染而设置。如果该反应孔的CT值小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。因此,必须从RNA样品中去除基因组和其他全部残余污染物。建议采用Qiagen 柱式抽提过程中加入DNAse去除基因组污染。

建议在进行PCR array 之前购买BioTNT 样本质量验证引物套装或者单独的GDC 引物进行基因组DNA 污染控制的质量验证;验证结果CT 值如果小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。

 

8. 如何进行样本的调平?

回答:进行PCR array之前,对样本需要进行调平。具体调平方式为:  

1.     RNA 含量调平:实验样本的RNA 尽量调到同一水平;加入RNA free的水,调整RNA浓度;

2.   调平后的样本:通过内参引物进行验证,根据CT 值,进行二次调平。

 

9. BioTNT PCR array定制费用如何?

回答:目前BioTNT PCR array 提供您的定制,仅比预制产品增加了400/板的定制费用。您可以把您要检测的指标给我们,然后把您的仪器型号,以及sample 数量,重复数量提供给我们,我们为您设置相应的PCR array 形式,并核算相应的费用给您。

BioTNT PCR array的定制,方式灵活,1 plate起订。

详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击定制服务

 

10.        如果我没有QPCR 仪器,BioTNT 能够提供什么服务?

回答:您可以选择BioTNT PCR array service

     详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击service

 

 

 

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