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PCR引物探针合成、修饰和标记
PCR 引物探针定制
siRNA/ gRNA 定制
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BioTNT PCR ARRAY of Human Tyrosine Kinases-酪氨酸…
    产品中心    >>  试剂    >>  BioTNT核酸PCR相关    >>  PCR Array 关   闭
PCR ARRAY of Human Tyrosine Kinases-酪氨酸激酶系列
分类:PCR Array
品牌:BioTNT
货号:A2020A0167H/S
原价:2080
现价:¥1602.00    节省:¥478
特异性种属:human
规格:96孔*2板
产品参数

一、产品介绍:


PCR Array

 

 

BioTNT qPCR Array专为检测不同组织或细胞中特定基因的表达量而设计,这些基因按照预制或定制要求成套设置。检测结果所显示的表达差异可帮助研究者鉴定或验证这些基因的生物学意义,以及与其研究的重要相关性。

对于目录(预制)产品,每块384孔板包含84对PCR引物,可以进行4个样本单孔或者两个样本双复的实验。这些引物全部经过预先验证,并包被于指定的板孔中。在同一块96孔板上,有12个(384孔板有48个)反应孔包被了不同类型的对照,用以检测从反转录到qPCR整个过程的反应效率。

逆转录试剂和以荧光染料SYBR?Green 为基础的定量检测试剂作为被推荐的RT-qPCR试剂产品可与qPCR Array配套使用。该系列试剂均经过优化,具有高的灵敏度、效率和特异性。其他公司的类似试剂可能适用,但未验证过,不推荐使用。

 

产品优势


BioTNT QPCR芯片特点:

灵敏度高,样本使用量低

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 


产品说明


The Human Tyrosine Kinases RT2 Profiler PCR Array profiles the expression of 84 receptor and non-receptor tyrosine kinase genes. The protein tyrosine kinase superfamily includes roughly 60 receptor tyrosine kinases (RTKs) and about 30 intracellular tyrosine kinases. RTKs include an extracellular domain, a transmembrane domain, and a catalytic intracellular domain. Upon activation, RTKs dimerize and autophosphorylate their intracellular domain, initiating downstream signaling that often includes non-receptor tyrosine kinases. Non-receptor tyrosine kinases include a catalytic domain and a regulatory domain, which vary for each family. For example, the SRC-family kinase regulatory domain requires autophosphorylation for kinase domain activation, while most other intracellular tyrosine kinase families use different regulatory mechanisms. Tyrosine kinases are involved in many basic biological processes, such as growth, proliferation, and differentiation. These processes are commonly dysregulated during oncogenesis, often due to mutation of key tyrosine kinases or regulators. These oncogenic processes make the tyrosine kinase superfamily members attractive drug targets, and there are several chemotherapeutics targeting tyrosine kinases already on the market (e.g., imatinib mesylate). This array includes most RTKs and non-receptor tyrosine kinases. The results of this array can yield new insights into tyrosine kinase expression and regulation in an experimental model system. Using real-time PCR, research studies can easily and reliably analyze the expression of a focused panel of tyrosine kinase genes with this array.

 

 

 

二.运输和储存条件:


4度运输。

-20°C储存至少6个月;

 

 

三.适用仪器:


lifetechnoliges(原ABI) 7900, Viaa 7 等可使用384微孔板的QPCR 仪器。

也可以定制其他机器形式:

Biotnt 可提供多种与以下qPCR仪器匹配的qPCR array类型。

重要提示:在订购前,请根据您的qPCR仪器型号选购合适的array类型;在收到产品后,请及时确认收到的array是否与您的qPCR仪器匹配。如果您的仪器类型不在下表所列类型中,请及时联系本公司技术支持咨询。

 

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900,ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900(standard 96well),ViiA7(standard 96well)

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block),7900HT(fast block),stepone plus,ViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCycler,MyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96,DNA Engine opticon,opticon 2,Chromo4

 

四.质量标准(QC


1. biotnt gene qPCR array中检测的基因引物,经实验验证结果分析,融解曲线均呈单一锐锋,电泳条带均呈单一条带,说明这些引物均是特异扩增引物,验证合格。

2. PTC(阳性对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于18~22之间。

3. RTC(spike-in反转录对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于17~23之间。

4. HGDC 的CT 值应大于35,说明样本中没有基因组污染。

5. RTC和 PTC的三重复CT 值应比较接近,说明实验重复性好。

6. 板与板之间(批内)重复性达0.99以上,具有高度重复性。

 

 

五.基因(引物)排布 :

每一个样本区里的基因排列如下:

 

 

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

基因1

基因2

基因3

基因4

基因5

基因6

基因7

基因8

基因9

基因10

基因11

基因12

B

基因13

基因14

基因15

基因16

基因17

基因18

基因19

基因20

基因21

基因22

基因23

基因24

C

基因25

基因26

基因27

基因28

基因29

基因30

基因31

基因32

基因33

基因34

基因35

基因36

D

基因37

基因38

基因39

基因40

基因41

基因42

基因43

基因44

基因45

基因46

基因47

基因48

E

基因49

基因50

基因51

基因52

基因53

基因54

基因55

基因56

基因57

基因58

基因59

基因60

F

基因61

基因62

基因63

基因64

基因65

基因66

基因67

基因68

基因69

基因70

基因71

基因72

G

基因73

基因74

基因75

基因76

基因77

基因78

基因79

基因80

基因81

基因82

基因83

基因84

H

HK1

HK2

HK3

GDC

GDC

GDC

RTC

RTC

RTC

PTC

PTC

PTC

 

& 基因引物:84个反应孔(从A排到G排)已预先交联好特异基因引物(详见基因引物列表)。

HK1-3:3条已交联的管家基因(内参)引物,可作为array数据标准化过程中样品的阳性对照。

&GDC:基因组DNA对照,可用于qPCR反应体系中是否有基因组DNA污染。

RTC:spike-in反转录对照,可用于检测RT反应的效率。这些已交联的引物可特异性扩增样品中外源性spike-in RNA反转录形成的cDNA模板。

PTC:阳性PCR对照,已交联DNA阳性质粒模板,主要用于实时监测array反应板的PCR扩增效率。

 

 

基因信息列表

A2020A0167H

PCR ARRAY of Human Tyrosine Kinases

序号

简称

货号

基因ID

基因1

ABL1

tnt2217a

25

基因2

ABL2

QHP27

27

基因3

ALK

QHP238

238

基因4

AXL

tnt5776a

558

基因5

BLK

QHP640

640

基因6

BTK

QHP695

695

基因7

CSF1R

tnt6225a

1436

基因8

CSK

QHP1445

1445

基因9

DDR1

tnt7450a

780

基因10

DDR2

tnt6274b

4921

基因11

EGFR

tnt7334b

1956

基因12

EPHA1

QHP2041

2041

基因13

EPHA2

tnt6248a

1969

基因14

EPHA3

QHP2042

2042

基因15

EPHA4

QHP2043

2043

基因16

EPHA5

QHP2044

2044

基因17

EPHA7

QHP2045

2045

基因18

EPHA8

QHP2046

2046

基因19

EPHB1

QHP2047

2047

基因20

EPHB2

tnt6985b

2048

基因21

EPHB3

QHP2049

2049

基因22

EPHB4

QHP2050

2050

基因23

EPHB6

QHP2051

2051

基因24

ERBB2

tnt3362a

2064

基因25

ERBB3

tnt3251b

2065

基因26

ERBB4

tnt9654a

2066

基因27

FER

QHP2241

2241

基因28

FES

QHP2242

2242

基因29

FGFR1

tnt5939b

2260

基因30

FGFR2

tnt6178b

2263

基因31

FGFR3

tnt1475b

2261

基因32

FGFR4

tnt2649a

2264

基因33

FGR

QHP2268

2268

基因34

FLT1

tnt5414b

2321

基因35

FLT3

QHP2322

2322

基因36

FLT4

tnt1182

2324

基因37

FRK

QHP2444

2444

基因38

FYN

tnt6377b

2534

基因39

HCK

QHP3055

3055

基因40

IGF1R

tnt1550b

3480

基因41

IGF2R

QHP3482

3482

基因42

INSR

tnt1897a

3643

基因43

INSRR

QHP3645

3645

基因44

ITK

tnt7146b

3702

基因45

JAK1

tnt2199a

3716

基因46

JAK2

tnt6632a

3717

基因47

JAK3

tnt2200b

3718

基因48

KDR

tnt4923b

3791

基因49

KIT

tnt1907b

3815

基因50

LCK

tnt7144b

3932

基因51

LTK

QHP4058

4058

基因52

LYN

tnt2676b

4067

基因53

MATK

QHP4145

4145

基因54

MERTK

tnt5777a

10461

基因55

MET

tnt2396b

4233

基因56

MST1R

tnt5146b

4486

基因57

MUSK

QHP4593

4593

基因58

NTRK1

tnt1217c1

4914

基因59

NTRK2

tnt5969a

4915

基因60

NTRK3

QHP4916

4916

基因61

PDGFRA

tnt9084a

5156

基因62

PDGFRB

tnt2806b

5159

基因63

PTK2

tnt5568a

5747

基因64

PTK2B

QHP2185

2185

基因65

PTK6

QHP5753

5753

基因66

PTK7

QHP5754

5754

基因67

RET

tnt1423

5979

基因68

ROR1

tnt6356b

4919

基因69

ROR2

tnt6357a

4920

基因70

ROS1

QHP6098

6098

基因71

RYK

QHP6259

6259

基因72

SRC

tnt3388a

6714

基因73

SRMS

QHP6725

6725

基因74

SYK

tnt5796a

6850

基因75

TEC

QHP7006

7006

基因76

TEK

tnt2934b

7010

基因77

TIE1

tnt3337a

7075

基因78

TNK1

QHP8711

8711

基因79

TNK2

QHP10188

10188

基因80

TXK

tnt1546

7294

基因81

TYK2

tnt2198a

7297

基因82

TYRO3

QHP7301

7301

基因83

YES1

QHP7525

7525

基因84

ZAP70

tnt6460a

7535

 

 

1.     任何一台能够做QPCR的仪器据能够做PCRarray吗?

回答:基本上任意一台的QPCR 仪器都可以进行QPCR array的实验。

BioTNT根据仪器采用的96孔或者384孔板,分为以下5种板型(plate format

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900standard 96well),ViiA7standard 96well

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block)7900HTfast block),stepone plusViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCyclerMyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96DNA Engine opticonopticon 2Chromo4

请您在订购时提供您使用的QPCR 仪器,我们也可以为您确定plate format;如果您的仪器不在以上清单上,也可以邮件咨询我们,我们会有专业的技术人员为您确定相应的plate format

 

2. BioTNT PCR array的适用在哪里?

回答:适用现有的通路研究;

适用少样本或中等样本,多基因的QPCR 检测;

在低样本或中等样本的情况下,费用和时间远小于自行建立QPCR实验;

使用方便,操作简单,结果稳定性好;

 

3. BioTNT PCR array的优点是什么?

回答:灵敏度高,样本使用量低;

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因;

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一;

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环;

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 

4. QPCR 得到实验数据后,如何进行后续的结果分析?需要配套的仪器设备吗?

回答: 您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击分析工具,然后再点击:分析软件下载下载后进行分析。不需要特殊的分析仪器。

 

5.   BioTNT PCR array,如果自己使用,需要购买哪些配套产品?

回答:您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击相关产品;

建议除了您要使用的PCR array 产品之外,您应购买以下产品,对PCR array进行配套使用:

PCR array cDNA第一链合成试剂盒 A2010B0B03  
Real time 染料PCR PreMIX A2010A0112
建议使用高品质的抽提试剂盒,推荐型号为:

Qiagen RNeasy Mini Kit (50) 74104
RNase-Free DNase Set (50)79254 

 

6. 如果使用其他公司的抽提试剂盒,如Trizol 法抽提试剂盒,能否使用BioTNTPCR array产品?

回答:建议抽提时尽量使用高质量的样本,高质量的抽提试剂盒,并在抽提时进行DNA 去除;使用PCR array 产品前,先进行样本质量的验证。能够通过样本质量验证的样本,可以进行PCR array实验。

 

7. 如何进行PCR array 实验前的样本质量验证?

回答:为了保证PCR array实验的质量,建议在使用前先进行样本质量验证;

RNA 定量与质量控制

A.  使用无菌水(RNase-free)稀释 RNA 样本,检测 260  nm  280  nm 吸光值,A260/280 应大于 1.8

B.  使用公式A260× 40 ×稀释倍数  = XXXXμg/mL 计算 RNA 浓度。

C.  使用琼脂糖凝胶电泳检测 RNA 完整性。

D.  建议:RNA 质量测定后,逆转录得到CDNA,建议用多个内参基因自行验证CDNA 质量;

推荐购买biotnt 的样本质量验证引物套装,可以在进行QPCR 之前对样本进行验证(包含内参引物,如human beta actin GAPDH,  18sRNA)

E.  基因组DNA污染控制

每个Array板块上的GDC(Genomic  DNA  Control)反应孔专为检测每个样品进行qPCR反应时可能存在的基因组DNA污染而设置。如果该反应孔的CT值小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。因此,必须从RNA样品中去除基因组和其他全部残余污染物。建议采用Qiagen 柱式抽提过程中加入DNAse去除基因组污染。

建议在进行PCR array 之前购买BioTNT 样本质量验证引物套装或者单独的GDC 引物进行基因组DNA 污染控制的质量验证;验证结果CT 值如果小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。

 

8. 如何进行样本的调平?

回答:进行PCR array之前,对样本需要进行调平。具体调平方式为:  

1.     RNA 含量调平:实验样本的RNA 尽量调到同一水平;加入RNA free的水,调整RNA浓度;

2.   调平后的样本:通过内参引物进行验证,根据CT 值,进行二次调平。

 

9. BioTNT PCR array定制费用如何?

回答:目前BioTNT PCR array 提供您的定制,仅比预制产品增加了400/板的定制费用。您可以把您要检测的指标给我们,然后把您的仪器型号,以及sample 数量,重复数量提供给我们,我们为您设置相应的PCR array 形式,并核算相应的费用给您。

BioTNT PCR array的定制,方式灵活,1 plate起订。

详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击定制服务

 

10.        如果我没有QPCR 仪器,BioTNT 能够提供什么服务?

回答:您可以选择BioTNT PCR array service

     详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击service

 

 

 

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产品搜索说明:
 
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