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BioTNT PCR ARRAY of Human WNT Signaling Pathway-…
    产品中心    >>  试剂    >>  BioTNT核酸PCR相关    >>  PCR Array 关   闭
PCR ARRAY of Human WNT Signaling Pathway-细胞外因子信号通路系列
分类:PCR Array
品牌:BioTNT
货号:A2020A0172H/S
原价:2080
现价:¥1602.00    节省:¥478
特异性种属:human
规格:96孔*2板
产品参数

一、产品介绍:


PCR Array

 

 

BioTNT qPCR Array专为检测不同组织或细胞中特定基因的表达量而设计,这些基因按照预制或定制要求成套设置。检测结果所显示的表达差异可帮助研究者鉴定或验证这些基因的生物学意义,以及与其研究的重要相关性。

对于目录(预制)产品,每块384孔板包含84对PCR引物,可以进行4个样本单孔或者两个样本双复的实验。这些引物全部经过预先验证,并包被于指定的板孔中。在同一块96孔板上,有12个(384孔板有48个)反应孔包被了不同类型的对照,用以检测从反转录到qPCR整个过程的反应效率。

逆转录试剂和以荧光染料SYBR?Green 为基础的定量检测试剂作为被推荐的RT-qPCR试剂产品可与qPCR Array配套使用。该系列试剂均经过优化,具有高的灵敏度、效率和特异性。其他公司的类似试剂可能适用,但未验证过,不推荐使用。

 

产品优势


BioTNT QPCR芯片特点:

灵敏度高,样本使用量低

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 


产品说明


The Human WNT Signaling Pathway RT2 Profiler PCR Array profiles the expression of 84 genes related to WNT-mediated signal transduction. The WNT family of secreted growth factors regulates the developmental processes of cell fate and polarity, as well as general cell maintenance processes such as homeostasis and cell cycle regulation. There are 19 WNT ligands in humans, which bind to the Frizzled (FZD) family of receptors and the co-receptors LRP5 and LRP6. WNT signaling comprises three pathways: the canonical pathway and two non-canonical pathways, planar cell polarity (PCP) and a calcium ion-dependent pathway. The well-studied canonical WNT pathway signals through ?-catenin and regulates the cell cycle, cell growth, and proliferation. The PCP pathway regulates cytoskeletal dynamics and cell motility, and the WNT/calcium pathway promotes NFAT transcription, both independently of ?-catenin signaling. This array contains WNT signaling ligands and receptors as well as other downstream signaling molecules for all three pathways. In addition, regulators of WNT signaling are included as well as downstream target genes. Using real-time PCR, you can easily and reliably analyze expression of a focused panel of genes related to WNT-mediated signal transduction with this array.

 

 

 

二.运输和储存条件:


4度运输。

-20°C储存至少6个月;

 

 

三.适用仪器:


lifetechnoliges(原ABI) 7900, Viaa 7 等可使用384微孔板的QPCR 仪器。

也可以定制其他机器形式:

Biotnt 可提供多种与以下qPCR仪器匹配的qPCR array类型。

重要提示:在订购前,请根据您的qPCR仪器型号选购合适的array类型;在收到产品后,请及时确认收到的array是否与您的qPCR仪器匹配。如果您的仪器类型不在下表所列类型中,请及时联系本公司技术支持咨询。

 

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900,ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900(standard 96well),ViiA7(standard 96well)

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block),7900HT(fast block),stepone plus,ViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCycler,MyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96,DNA Engine opticon,opticon 2,Chromo4

 

四.质量标准(QC


1. biotnt gene qPCR array中检测的基因引物,经实验验证结果分析,融解曲线均呈单一锐锋,电泳条带均呈单一条带,说明这些引物均是特异扩增引物,验证合格。

2. PTC(阳性对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于18~22之间。

3. RTC(spike-in反转录对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于17~23之间。

4. HGDC 的CT 值应大于35,说明样本中没有基因组污染。

5. RTC和 PTC的三重复CT 值应比较接近,说明实验重复性好。

6. 板与板之间(批内)重复性达0.99以上,具有高度重复性。

 

 

五.基因(引物)排布 :

每一个样本区里的基因排列如下:

 

 

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

基因1

基因2

基因3

基因4

基因5

基因6

基因7

基因8

基因9

基因10

基因11

基因12

B

基因13

基因14

基因15

基因16

基因17

基因18

基因19

基因20

基因21

基因22

基因23

基因24

C

基因25

基因26

基因27

基因28

基因29

基因30

基因31

基因32

基因33

基因34

基因35

基因36

D

基因37

基因38

基因39

基因40

基因41

基因42

基因43

基因44

基因45

基因46

基因47

基因48

E

基因49

基因50

基因51

基因52

基因53

基因54

基因55

基因56

基因57

基因58

基因59

基因60

F

基因61

基因62

基因63

基因64

基因65

基因66

基因67

基因68

基因69

基因70

基因71

基因72

G

基因73

基因74

基因75

基因76

基因77

基因78

基因79

基因80

基因81

基因82

基因83

基因84

H

HK1

HK2

HK3

GDC

GDC

GDC

RTC

RTC

RTC

PTC

PTC

PTC

 

& 基因引物:84个反应孔(从A排到G排)已预先交联好特异基因引物(详见基因引物列表)。

HK1-3:3条已交联的管家基因(内参)引物,可作为array数据标准化过程中样品的阳性对照。

&GDC:基因组DNA对照,可用于qPCR反应体系中是否有基因组DNA污染。

RTC:spike-in反转录对照,可用于检测RT反应的效率。这些已交联的引物可特异性扩增样品中外源性spike-in RNA反转录形成的cDNA模板。

PTC:阳性PCR对照,已交联DNA阳性质粒模板,主要用于实时监测array反应板的PCR扩增效率。

 

 

基因信息列表

A2020A0172H

PCR ARRAY of Human WNT Signaling Pathway

序号

简称

货号

基因ID

基因1

AES

QHP166

166

基因2

APC

tnt6823b

324

基因3

AXIN1

tnt6824a

8312

基因4

AXIN2

tnt1406

8313

基因5

BCL9

QHP607

607

基因6

BTRC

tnt4665a

8945

基因7

CCND1

tnt5368b

595

基因8

CCND2

tnt3365a

894

基因9

CSNK1A1

QHP1452

1452

基因10

CSNK2A1

tnt6459b

1457

基因11

CTBP1

tnt6981a

1487

基因12

CTNNB1

tnt5366a

1499

基因13

CTNNBIP1

QHP56998

56998

基因14

CXXC4

tnth10530a

80319

基因15

DAAM1

QHP23002

23002

基因16

DAB2

tnt3812a

1601

基因17

DIXDC1

QHP85458

85458

基因18

DKK1

tnt7448a

22943

基因19

DKK3

QHP27122

27122

基因20

DVL1

tnt6825b

1855

基因21

DVL2

tnt6826a

1856

基因22

EP300

tnt3778b

2033

基因23

FBXW11

QHP23291

23291

基因24

FBXW4

QHP6468

6468

基因25

FGF4

QHP2249

2249

基因26

FOSL1

tnt2759b

8061

基因27

FOXN1

tnt4040a

8456

基因28

FRAT1

QHP10023

10023

基因29

FRZB

tnt2906c

2487

基因30

FZD1

QHP8321

8321

基因31

FZD2

tnt2280b

2535

基因32

FZD3

QHP7976

7976

基因33

FZD4

tnt3721a

8322

基因34

FZD5

tnt5367b

7855

基因35

FZD6

QHP8323

8323

基因36

FZD7

tnt3366a

8324

基因37

FZD8

tnt7488b

8325

基因38

FZD9

QHP8326

8326

基因39

GSK3A

tnt5901b

2931

基因40

GSK3B

tnt5902a

2932

基因41

JUN

tnt3244b

3725

基因42

KREMEN1

QHP83999

83999

基因43

LEF1

tnt1408

51176

基因44

LRP5

QHP4041

4041

基因45

LRP6

tnt8951a

4040

基因46

MAPK8

tnt2354b

5599

基因47

MMP7

tnt5630b

4316

基因48

MYC

tnt5255b

4609

基因49

NFATC1

tnt2783b

4772

基因50

NKD1

QHP85407

85407

基因51

NLK

QHP51701

51701

基因52

PITX2

tnt9039a

5308

基因53

PORCN

tnth10192a

64840

基因54

PPARD

tnt5801a

5467

基因55

PRICKLE1

QHP144165

144165

基因56

PYGO1

QHP26108

26108

基因57

RHOA

tnt6562b

387

基因58

RHOU

QHP58480

58480

基因59

RUVBL1

QHP8607

8607

基因60

SFRP1

tnt8342a

6422

基因61

SFRP4

tnt9727a

6424

基因62

SOX17

QHP64321

64321

基因63

TCF7

tnt6578b

6932

基因64

TCF7L1

QHP83439

83439

基因65

TLE1

QHP7088

7088

基因66

VANGL2

QHP57216

57216

基因67

WIF1

tnt1945a

11197

基因68

CCN4

tnt8991a

8840

基因69

WNT1

tnt6573c1

7471

基因70

WNT10A

tnt3958a

80326

基因71

WNT11

tnt3941b

7481

基因72

WNT16

tnt3942a

51384

基因73

WNT2

tnt3951b

7472

基因74

WNT2B

tnt3833b

7482

基因75

WNT3

tnt3952b

7473

基因76

WNT3A

tnt6572a

89780

基因77

WNT4

tnt3953a

54361

基因78

WNT5A

tnt5569a

7474

基因79

WNT5B

tnt2932b

81029

基因80

WNT6

tnt3834c

7475

基因81

WNT7A

tnt3954a

7476

基因82

WNT7B

tnt3955a

7477

基因83

WNT8A

QHP7478

7478

基因84

WNT9A

tnt3957a

7483

 

 

1.     任何一台能够做QPCR的仪器据能够做PCRarray吗?

回答:基本上任意一台的QPCR 仪器都可以进行QPCR array的实验。

BioTNT根据仪器采用的96孔或者384孔板,分为以下5种板型(plate format

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900standard 96well),ViiA7standard 96well

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block)7900HTfast block),stepone plusViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCyclerMyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96DNA Engine opticonopticon 2Chromo4

请您在订购时提供您使用的QPCR 仪器,我们也可以为您确定plate format;如果您的仪器不在以上清单上,也可以邮件咨询我们,我们会有专业的技术人员为您确定相应的plate format

 

2. BioTNT PCR array的适用在哪里?

回答:适用现有的通路研究;

适用少样本或中等样本,多基因的QPCR 检测;

在低样本或中等样本的情况下,费用和时间远小于自行建立QPCR实验;

使用方便,操作简单,结果稳定性好;

 

3. BioTNT PCR array的优点是什么?

回答:灵敏度高,样本使用量低;

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因;

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一;

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环;

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 

4. QPCR 得到实验数据后,如何进行后续的结果分析?需要配套的仪器设备吗?

回答: 您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击分析工具,然后再点击:分析软件下载下载后进行分析。不需要特殊的分析仪器。

 

5.   BioTNT PCR array,如果自己使用,需要购买哪些配套产品?

回答:您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击相关产品;

建议除了您要使用的PCR array 产品之外,您应购买以下产品,对PCR array进行配套使用:

PCR array cDNA第一链合成试剂盒 A2010B0B03  
Real time 染料PCR PreMIX A2010A0112
建议使用高品质的抽提试剂盒,推荐型号为:

Qiagen RNeasy Mini Kit (50) 74104
RNase-Free DNase Set (50)79254 

 

6. 如果使用其他公司的抽提试剂盒,如Trizol 法抽提试剂盒,能否使用BioTNTPCR array产品?

回答:建议抽提时尽量使用高质量的样本,高质量的抽提试剂盒,并在抽提时进行DNA 去除;使用PCR array 产品前,先进行样本质量的验证。能够通过样本质量验证的样本,可以进行PCR array实验。

 

7. 如何进行PCR array 实验前的样本质量验证?

回答:为了保证PCR array实验的质量,建议在使用前先进行样本质量验证;

RNA 定量与质量控制

A.  使用无菌水(RNase-free)稀释 RNA 样本,检测 260  nm  280  nm 吸光值,A260/280 应大于 1.8

B.  使用公式A260× 40 ×稀释倍数  = XXXXμg/mL 计算 RNA 浓度。

C.  使用琼脂糖凝胶电泳检测 RNA 完整性。

D.  建议:RNA 质量测定后,逆转录得到CDNA,建议用多个内参基因自行验证CDNA 质量;

推荐购买biotnt 的样本质量验证引物套装,可以在进行QPCR 之前对样本进行验证(包含内参引物,如human beta actin GAPDH,  18sRNA)

E.  基因组DNA污染控制

每个Array板块上的GDC(Genomic  DNA  Control)反应孔专为检测每个样品进行qPCR反应时可能存在的基因组DNA污染而设置。如果该反应孔的CT值小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。因此,必须从RNA样品中去除基因组和其他全部残余污染物。建议采用Qiagen 柱式抽提过程中加入DNAse去除基因组污染。

建议在进行PCR array 之前购买BioTNT 样本质量验证引物套装或者单独的GDC 引物进行基因组DNA 污染控制的质量验证;验证结果CT 值如果小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。

 

8. 如何进行样本的调平?

回答:进行PCR array之前,对样本需要进行调平。具体调平方式为:  

1.     RNA 含量调平:实验样本的RNA 尽量调到同一水平;加入RNA free的水,调整RNA浓度;

2.   调平后的样本:通过内参引物进行验证,根据CT 值,进行二次调平。

 

9. BioTNT PCR array定制费用如何?

回答:目前BioTNT PCR array 提供您的定制,仅比预制产品增加了400/板的定制费用。您可以把您要检测的指标给我们,然后把您的仪器型号,以及sample 数量,重复数量提供给我们,我们为您设置相应的PCR array 形式,并核算相应的费用给您。

BioTNT PCR array的定制,方式灵活,1 plate起订。

详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击定制服务

 

10.        如果我没有QPCR 仪器,BioTNT 能够提供什么服务?

回答:您可以选择BioTNT PCR array service

     详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击service

 

 

 

产品咨询:sales@biotnt.com    BioTNT订阅号:
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