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BioTNT PCR ARRAY of Rat Adipogenesis+ primer
    产品中心    >>  试剂    >>  分子生物学试剂    >>  PCR Array 关   闭
PCR ARRAY of Rat Adipogenesis+ primer
分类:PCR Array
品牌:BioTNT
货号:A2020A0002R/B
原价:7200
现价:¥5538.00    节省:¥1662
特异性种属:rat
规格:250板
产品参数

一、产品介绍:


PCR Array

 

 

BioTNT qPCR Array专为检测不同组织或细胞中特定基因的表达量而设计,这些基因按照预制或定制要求成套设置。检测结果所显示的表达差异可帮助研究者鉴定或验证这些基因的生物学意义,以及与其研究的重要相关性。

对于目录(预制)产品,每块384孔板包含84对PCR引物,可以进行4个样本单孔或者两个样本双复的实验。这些引物全部经过预先验证,并包被于指定的板孔中。在同一块96孔板上,有12个(384孔板有48个)反应孔包被了不同类型的对照,用以检测从反转录到qPCR整个过程的反应效率。

逆转录试剂和以荧光染料SYBR?Green 为基础的定量检测试剂作为被推荐的RT-qPCR试剂产品可与qPCR Array配套使用。该系列试剂均经过优化,具有高的灵敏度、效率和特异性。其他公司的类似试剂可能适用,但未验证过,不推荐使用。

 

产品优势


BioTNT QPCR芯片特点:

灵敏度高,样本使用量低

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 


产品说明

   

PCR Array introduction:The Rat Adipogenesis RT2 Profiler? PCR Array profiles the expression of 84 key genes involved in the differentiation and maintenance of mature adipocytes. Preadipocytes differentiate into mature adipocytes and generally form adipose tissue in response to a positive energy balance. Adipose tissue not only stores energy, but is also a dynamic endocrine organ, important for hormone and cytokine (adipokine) secretion. White adipose tissue (WAT), located in abdominal and subcutaneous deposits in mammals, performs the majority of energy storage and adipokine secretion. Brown adipose tissue (BAT) mediates non-shivering thermogenesis, well-known to protect infants from cold exposure. Recent studies have also discovered significant BAT deposits in adults, which may play an important role in obesity and energy balance, leading to potential therapeutic options for metabolic syndrome and diabetes. The differentiation and maintenance of these two types of adipose tissue is interrelated, involving multiple signaling pathways and transcription factors whose expression varies over time. This array includes the major genes implicated in WAT and BAT adipogenesis, such as hormones, adipokines, enzymes, transcription factors (particularly PPAR gamma and the C/EBP family) and signal transduction ligands, essential for studying the complex interactions between WAT and BAT. Using real-time PCR, you can easily and reliably analyze the expression of a focused panel of genes involved in adipogenesis with this array.

 

 

 

二.运输和储存条件:


4度运输。

-20°C储存至少6个月;

 

 

三.适用仪器:


lifetechnoliges(原ABI) 7900, Viaa 7 等可使用384微孔板的QPCR 仪器。

也可以定制其他机器形式:

Biotnt 可提供多种与以下qPCR仪器匹配的qPCR array类型。

重要提示:在订购前,请根据您的qPCR仪器型号选购合适的array类型;在收到产品后,请及时确认收到的array是否与您的qPCR仪器匹配。如果您的仪器类型不在下表所列类型中,请及时联系本公司技术支持咨询。

 

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900,ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900(standard 96well),ViiA7(standard 96well)

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block),7900HT(fast block),stepone plus,ViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCycler,MyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96,DNA Engine opticon,opticon 2,Chromo4

 

四.质量标准(QC


1. biotnt gene qPCR array中检测的基因引物,经实验验证结果分析,融解曲线均呈单一锐锋,电泳条带均呈单一条带,说明这些引物均是特异扩增引物,验证合格。

2. PTC(阳性对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于18~22之间。

3. RTC(spike-in反转录对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于17~23之间。

4. HGDC 的CT 值应大于35,说明样本中没有基因组污染。

5. RTC和 PTC的三重复CT 值应比较接近,说明实验重复性好。

6. 板与板之间(批内)重复性达0.99以上,具有高度重复性。

 

 

五.基因(引物)排布 :

每一个样本区里的基因排列如下:

 

 

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

基因1

基因2

基因3

基因4

基因5

基因6

基因7

基因8

基因9

基因10

基因11

基因12

B

基因13

基因14

基因15

基因16

基因17

基因18

基因19

基因20

基因21

基因22

基因23

基因24

C

基因25

基因26

基因27

基因28

基因29

基因30

基因31

基因32

基因33

基因34

基因35

基因36

D

基因37

基因38

基因39

基因40

基因41

基因42

基因43

基因44

基因45

基因46

基因47

基因48

E

基因49

基因50

基因51

基因52

基因53

基因54

基因55

基因56

基因57

基因58

基因59

基因60

F

基因61

基因62

基因63

基因64

基因65

基因66

基因67

基因68

基因69

基因70

基因71

基因72

G

基因73

基因74

基因75

基因76

基因77

基因78

基因79

基因80

基因81

基因82

基因83

基因84

H

HK1

HK2

HK3

GDC

GDC

GDC

RTC

RTC

RTC

PTC

PTC

PTC

 

& 基因引物:84个反应孔(从A排到G排)已预先交联好特异基因引物(详见基因引物列表)。

HK1-3:3条已交联的管家基因(内参)引物,可作为array数据标准化过程中样品的阳性对照。

&GDC:基因组DNA对照,可用于qPCR反应体系中是否有基因组DNA污染。

RTC:spike-in反转录对照,可用于检测RT反应的效率。这些已交联的引物可特异性扩增样品中外源性spike-in RNA反转录形成的cDNA模板。

PTC:阳性PCR对照,已交联DNA阳性质粒模板,主要用于实时监测array反应板的PCR扩增效率。

 

 

基因引物列表

 

  Symbol GeneBank
基因1  Acacb  NM_053922
基因2  Adipoq  NM_144744
基因3  Adrb2  NM_012492
基因4  Agt  NM_134432
基因5  Angpt2  NM_134454
基因6  Axin1  NM_024405
基因7  Bmp2  NM_017178
基因8  Bmp4  NM_012827
基因9  Bmp7  NM_001191856
基因10  Ccnd1  NM_171992
基因11  Cdk4  NM_053593
基因12  Cdkn1a  NM_080782
基因13  Cdkn1b  NM_031762
基因14  Cebpa  NM_012524
基因15  Cebpb  NM_024125
基因16  Cebpd  NM_013154
基因17  Cfd  NM_001077642
基因18  Creb1  NM_031017
基因19  Ddit3  NM_024134
基因20  Dio2  NM_031720
基因21  Dkk1  NM_001106350
基因22  Dlk1  NM_053744
基因23  E2f1  NM_001100778
基因24  Egr2  NM_053633
基因25  Fabp4  NM_053365
基因26  Fasn  NM_017332
基因27  Fgf1  NM_012846
基因28  Fgf10  NM_012951
基因29  Fgf2  NM_019305
基因30  Fos  NM_022197
基因31  Foxc2  NM_001101680
基因32  Gata2  NM_033442
基因33  Gata3  NM_133293
基因34  Hes1  NM_024360
基因35  Insr  NM_017071
基因36  Irs1  NM_012969
基因37  Irs2  NM_001168633
基因38  Jun  NM_021835
基因39  Klf15  NM_053536
基因40  Klf2  NM_001007684
基因41  Klf3  NM_001105742
基因42  Klf4  NM_053713
基因43  Lep  NM_013076
基因44  Lipe  NM_012859
基因45  Lmna  NM_001002016
基因46  Lpl  NM_012598
基因47  Lrp5  NM_001106321
基因48  Mapk14  NM_031020
基因49  Ncoa2  NM_031822
基因50  Ncor1  NM_001271103
基因51  Ncor2  NM_001108334
基因52  Nr0b2  NM_057133
基因53  Nr1h3  NM_031627
基因54  Nrf1  NM_001100708
基因55  Ppara  NM_013196
基因56  Ppard  NM_013141
基因57  Pparg  NM_013124
基因58  Ppargc1a  NM_031347
基因59  Ppargc1b  NM_176075
基因60  Rb1  NM_017045
基因61  Retn  NM_144741
基因62  Runx1t1  NM_001108657
基因63  Rxra  NM_012805
基因64  Sfrp1  NM_001276712
基因65  Sfrp5  NM_001107591
基因66  Shh  NM_017221
基因67  Sirt1  NM_001107627
基因68  Sirt2  NM_001008368
基因69  Sirt3  NM_001106313
基因70  Slc2a4  NM_012751
基因71  Src  NM_031977
基因72  Srebf1  NM_001276707
基因73  Stat5a  NM_017064
基因74  Taz  NM_001025748
基因75  Tcf7l2  NM_001191052
基因76  Tsc22d3  NM_031345
基因77  Twist1  NM_053530
基因78  Ucp1  NM_012682
基因79  Vdr  NM_017058
基因80  Wnt1  NM_001105714
基因81  Wnt10b  NM_001108111
基因82  Wnt3a  NM_001107005
基因83  Wnt5a  NM_022631
基因84  Wnt5b  NM_001100489

1.     任何一台能够做QPCR的仪器据能够做PCRarray吗?

回答:基本上任意一台的QPCR 仪器都可以进行QPCR array的实验。

BioTNT根据仪器采用的96孔或者384孔板,分为以下5种板型(plate format

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900standard 96well),ViiA7standard 96well

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block)7900HTfast block),stepone plusViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCyclerMyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96DNA Engine opticonopticon 2Chromo4

请您在订购时提供您使用的QPCR 仪器,我们也可以为您确定plate format;如果您的仪器不在以上清单上,也可以邮件咨询我们,我们会有专业的技术人员为您确定相应的plate format

 

2. BioTNT PCR array的适用在哪里?

回答:适用现有的通路研究;

适用少样本或中等样本,多基因的QPCR 检测;

在低样本或中等样本的情况下,费用和时间远小于自行建立QPCR实验;

使用方便,操作简单,结果稳定性好;

 

3. BioTNT PCR array的优点是什么?

回答:灵敏度高,样本使用量低;

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因;

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一;

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环;

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 

4. QPCR 得到实验数据后,如何进行后续的结果分析?需要配套的仪器设备吗?

回答: 您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击分析工具,然后再点击:分析软件下载下载后进行分析。不需要特殊的分析仪器。

 

5.   BioTNT PCR array,如果自己使用,需要购买哪些配套产品?

回答:您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击相关产品;

建议除了您要使用的PCR array 产品之外,您应购买以下产品,对PCR array进行配套使用:

PCR array cDNA第一链合成试剂盒 A2010B0B03  
Real time 染料PCR PreMIX A2010A0112
建议使用高品质的抽提试剂盒,推荐型号为:

Qiagen RNeasy Mini Kit (50) 74104
RNase-Free DNase Set (50)79254 

 

6. 如果使用其他公司的抽提试剂盒,如Trizol 法抽提试剂盒,能否使用BioTNTPCR array产品?

回答:建议抽提时尽量使用高质量的样本,高质量的抽提试剂盒,并在抽提时进行DNA 去除;使用PCR array 产品前,先进行样本质量的验证。能够通过样本质量验证的样本,可以进行PCR array实验。

 

7. 如何进行PCR array 实验前的样本质量验证?

回答:为了保证PCR array实验的质量,建议在使用前先进行样本质量验证;

RNA 定量与质量控制

A.  使用无菌水(RNase-free)稀释 RNA 样本,检测 260  nm  280  nm 吸光值,A260/280 应大于 1.8

B.  使用公式A260× 40 ×稀释倍数  = XXXXμg/mL 计算 RNA 浓度。

C.  使用琼脂糖凝胶电泳检测 RNA 完整性。

D.  建议:RNA 质量测定后,逆转录得到CDNA,建议用多个内参基因自行验证CDNA 质量;

推荐购买biotnt 的样本质量验证引物套装,可以在进行QPCR 之前对样本进行验证(包含内参引物,如human beta actin GAPDH,  18sRNA)

E.  基因组DNA污染控制

每个Array板块上的GDC(Genomic  DNA  Control)反应孔专为检测每个样品进行qPCR反应时可能存在的基因组DNA污染而设置。如果该反应孔的CT值小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。因此,必须从RNA样品中去除基因组和其他全部残余污染物。建议采用Qiagen 柱式抽提过程中加入DNAse去除基因组污染。

建议在进行PCR array 之前购买BioTNT 样本质量验证引物套装或者单独的GDC 引物进行基因组DNA 污染控制的质量验证;验证结果CT 值如果小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。

 

8. 如何进行样本的调平?

回答:进行PCR array之前,对样本需要进行调平。具体调平方式为:  

1.     RNA 含量调平:实验样本的RNA 尽量调到同一水平;加入RNA free的水,调整RNA浓度;

2.   调平后的样本:通过内参引物进行验证,根据CT 值,进行二次调平。

 

9. BioTNT PCR array定制费用如何?

回答:目前BioTNT PCR array 提供您的定制,仅比预制产品增加了400/板的定制费用。您可以把您要检测的指标给我们,然后把您的仪器型号,以及sample 数量,重复数量提供给我们,我们为您设置相应的PCR array 形式,并核算相应的费用给您。

BioTNT PCR array的定制,方式灵活,1 plate起订。

详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击定制服务

 

10.        如果我没有QPCR 仪器,BioTNT 能够提供什么服务?

回答:您可以选择BioTNT PCR array service

     详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击service

 

 

 

产品咨询:sales@biotnt.com    BioTNT订阅号:
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