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BioTNT PCR ARRAY of Human PPAR Targets+ primer
    产品中心    >>  试剂    >>  分子生物学试剂    >>  PCR Array 关   闭
PCR ARRAY of Human PPAR Targets+ primer
分类:PCR Array
品牌:BioTNT
货号:A2020A0137H/B
原价:7200
现价:¥5538.00    节省:¥1662
特异性种属:human
规格:250板
产品参数

一、产品介绍:


PCR Array

 

 

BioTNT qPCR Array专为检测不同组织或细胞中特定基因的表达量而设计,这些基因按照预制或定制要求成套设置。检测结果所显示的表达差异可帮助研究者鉴定或验证这些基因的生物学意义,以及与其研究的重要相关性。

对于目录(预制)产品,每块384孔板包含84对PCR引物,可以进行4个样本单孔或者两个样本双复的实验。这些引物全部经过预先验证,并包被于指定的板孔中。在同一块96孔板上,有12个(384孔板有48个)反应孔包被了不同类型的对照,用以检测从反转录到qPCR整个过程的反应效率。

逆转录试剂和以荧光染料SYBR?Green 为基础的定量检测试剂作为被推荐的RT-qPCR试剂产品可与qPCR Array配套使用。该系列试剂均经过优化,具有高的灵敏度、效率和特异性。其他公司的类似试剂可能适用,但未验证过,不推荐使用。

 

产品优势


BioTNT QPCR芯片特点:

灵敏度高,样本使用量低

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 


产品说明


The Human PPAR Targets RT2 Profiler PCR Array profiles the expression of 84 key genes involved in peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR) activation and response. The PPARs are nuclear hormone receptors important in regulating lipid metabolism, cellular differentiation, and proliferation. The 3 PPAR isoforms have similar functions but different tissue distributions: alpha (adipose tissue, liver, and muscle), beta/delta (widely-expressed), and gamma (adipose tissue and muscle). Ligands such as fatty acids activate these receptors causing them to heterodimerize with the retinoid X receptors (RXR) and initiate transcription of target genes. Multiple different coactivators and corepressors interact with the PPAR/RXR heterodimers to direct target gene specificity. Dysregulation of PPAR activity is a potential cause of metabolic syndrome-related disorders, such as insulin resistance and hypercholesterolemia. This array includes PPAR targets involved in adipogenesis, lipid transport and metabolism, and insulin signaling. Genes involved in PPAR ligand transport as well as transcription factors and cofactors are also included. Using real-time PCR, research studies can easily and reliably analyze the expression of a focused panel of genes involved in PPAR signal transduction with this array.

 

 

 

二.运输和储存条件:


4度运输。

-20°C储存至少6个月;

 

 

三.适用仪器:


lifetechnoliges(原ABI) 7900, Viaa 7 等可使用384微孔板的QPCR 仪器。

也可以定制其他机器形式:

Biotnt 可提供多种与以下qPCR仪器匹配的qPCR array类型。

重要提示:在订购前,请根据您的qPCR仪器型号选购合适的array类型;在收到产品后,请及时确认收到的array是否与您的qPCR仪器匹配。如果您的仪器类型不在下表所列类型中,请及时联系本公司技术支持咨询。

 

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900,ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900(standard 96well),ViiA7(standard 96well)

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block),7900HT(fast block),stepone plus,ViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCycler,MyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96,DNA Engine opticon,opticon 2,Chromo4

 

四.质量标准(QC


1. biotnt gene qPCR array中检测的基因引物,经实验验证结果分析,融解曲线均呈单一锐锋,电泳条带均呈单一条带,说明这些引物均是特异扩增引物,验证合格。

2. PTC(阳性对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于18~22之间。

3. RTC(spike-in反转录对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于17~23之间。

4. HGDC 的CT 值应大于35,说明样本中没有基因组污染。

5. RTC和 PTC的三重复CT 值应比较接近,说明实验重复性好。

6. 板与板之间(批内)重复性达0.99以上,具有高度重复性。

 

 

五.基因(引物)排布 :

每一个样本区里的基因排列如下:

 

 

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

基因1

基因2

基因3

基因4

基因5

基因6

基因7

基因8

基因9

基因10

基因11

基因12

B

基因13

基因14

基因15

基因16

基因17

基因18

基因19

基因20

基因21

基因22

基因23

基因24

C

基因25

基因26

基因27

基因28

基因29

基因30

基因31

基因32

基因33

基因34

基因35

基因36

D

基因37

基因38

基因39

基因40

基因41

基因42

基因43

基因44

基因45

基因46

基因47

基因48

E

基因49

基因50

基因51

基因52

基因53

基因54

基因55

基因56

基因57

基因58

基因59

基因60

F

基因61

基因62

基因63

基因64

基因65

基因66

基因67

基因68

基因69

基因70

基因71

基因72

G

基因73

基因74

基因75

基因76

基因77

基因78

基因79

基因80

基因81

基因82

基因83

基因84

H

HK1

HK2

HK3

GDC

GDC

GDC

RTC

RTC

RTC

PTC

PTC

PTC

 

& 基因引物:84个反应孔(从A排到G排)已预先交联好特异基因引物(详见基因引物列表)。

HK1-3:3条已交联的管家基因(内参)引物,可作为array数据标准化过程中样品的阳性对照。

&GDC:基因组DNA对照,可用于qPCR反应体系中是否有基因组DNA污染。

RTC:spike-in反转录对照,可用于检测RT反应的效率。这些已交联的引物可特异性扩增样品中外源性spike-in RNA反转录形成的cDNA模板。

PTC:阳性PCR对照,已交联DNA阳性质粒模板,主要用于实时监测array反应板的PCR扩增效率。

 

 

基因信息列表


  Symbol GeneBank
基因1 ACAA2 NM_006111
基因2 ACADL NM_001608
基因3 ACADM NM_000016
基因4 ACOX1 NM_004035
基因5 ACOX3 NM_003501
基因6 ACSL1 NM_001995
基因7 ACSL3 NM_004457
基因8 ACSL4 NM_004458
基因9 ACSL5 NM_016234
基因10 ADIPOQ NM_004797
基因11 ANGPTL4 NM_001039667
基因12 APOA1 NM_000039
基因13 APOA5 NM_052968
基因14 APOC3 NM_000040
基因15 APOE NM_000041
基因16 CD36 NM_000072
基因17 CHD9 NM_025134
基因18 CLU NM_001831
基因19 CPT1A NM_001876
基因20 CPT1B NM_004377
基因21 CPT2 NM_000098
基因22 CREB1 NM_004379
基因23 CREBBP NM_004380
基因24 CYP27A1 NM_000784
基因25 CYP4A11 NM_000778
基因26 CYP7A1 NM_000780
基因27 DGAT1 NM_012079
基因28 ECH1 NM_001398
基因29 EHHADH NM_001966
基因30 ELN NM_000501
基因31 EP300 NM_001429
基因32 ETFDH NM_004453
基因33 FABP1 NM_001443
基因34 FABP2 NM_000134
基因35 FABP3 NM_004102
基因36 FABP4 NM_001442
基因37 FABP5 NM_001444
基因38 FABP6 NM_001445
基因39 FABP7 NM_001446
基因40 FADS2 NM_004265
基因41 FGR NM_005248
基因42 GK NM_000167
基因43 HIF1A NM_001530
基因44 HMGCS2 NM_005518
基因45 ILK NM_004517
基因46 KLF10 NM_005655
基因47 LPIN1 NM_145693
基因48 LPL NM_000237
基因49 MED1 NM_004774
基因50 MLYCD NM_012213
基因51 MMP9 NM_004994
基因52 NCOA3 NM_181659
基因53 NCOA6 NM_014071
基因54 NR1H3 NM_005693
基因55 OLR1 NM_002543
基因56 PCK1 NM_002591
基因57 PCK2 NM_004563
基因58 PDPK1 NM_002613
基因59 PLTP NM_006227
基因60 PPARA NM_005036
基因61 PPARD NM_006238
基因62 PPARG NM_015869
基因63 PPARGC1A NM_013261
基因64 PPARGC1B NM_133263
基因65 PPRC1 NM_015062
基因66 HELZ2 NM_033405
基因67 PTEN NM_000314
基因68 RXRA NM_002957
基因69 RXRB NM_021976
基因70 RXRG NM_006917
基因71 SCD NM_005063
基因72 SIRT1 NM_012238
基因73 SLC22A5 NM_003060
基因74 SLC27A1 NM_198580
基因75 SLC27A2 NM_003645
基因76 SLC27A4 NM_005094
基因77 SLC27A5 NM_012254
基因78 SLC27A6 NM_014031
基因79 SMARCD3 NM_003078
基因80 SORBS1 NM_006434
基因81 SRC NM_005417
基因82 TGS1 NM_024831
基因83 TXNIP NM_006472
基因84 UCP1 NM_021833

1.     任何一台能够做QPCR的仪器据能够做PCRarray吗?

回答:基本上任意一台的QPCR 仪器都可以进行QPCR array的实验。

BioTNT根据仪器采用的96孔或者384孔板,分为以下5种板型(plate format

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900standard 96well),ViiA7standard 96well

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block)7900HTfast block),stepone plusViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCyclerMyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96DNA Engine opticonopticon 2Chromo4

请您在订购时提供您使用的QPCR 仪器,我们也可以为您确定plate format;如果您的仪器不在以上清单上,也可以邮件咨询我们,我们会有专业的技术人员为您确定相应的plate format

 

2. BioTNT PCR array的适用在哪里?

回答:适用现有的通路研究;

适用少样本或中等样本,多基因的QPCR 检测;

在低样本或中等样本的情况下,费用和时间远小于自行建立QPCR实验;

使用方便,操作简单,结果稳定性好;

 

3. BioTNT PCR array的优点是什么?

回答:灵敏度高,样本使用量低;

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因;

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一;

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环;

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 

4. QPCR 得到实验数据后,如何进行后续的结果分析?需要配套的仪器设备吗?

回答: 您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击分析工具,然后再点击:分析软件下载下载后进行分析。不需要特殊的分析仪器。

 

5.   BioTNT PCR array,如果自己使用,需要购买哪些配套产品?

回答:您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击相关产品;

建议除了您要使用的PCR array 产品之外,您应购买以下产品,对PCR array进行配套使用:

PCR array cDNA第一链合成试剂盒 A2010B0B03  
Real time 染料PCR PreMIX A2010A0112
建议使用高品质的抽提试剂盒,推荐型号为:

Qiagen RNeasy Mini Kit (50) 74104
RNase-Free DNase Set (50)79254 

 

6. 如果使用其他公司的抽提试剂盒,如Trizol 法抽提试剂盒,能否使用BioTNTPCR array产品?

回答:建议抽提时尽量使用高质量的样本,高质量的抽提试剂盒,并在抽提时进行DNA 去除;使用PCR array 产品前,先进行样本质量的验证。能够通过样本质量验证的样本,可以进行PCR array实验。

 

7. 如何进行PCR array 实验前的样本质量验证?

回答:为了保证PCR array实验的质量,建议在使用前先进行样本质量验证;

RNA 定量与质量控制

A.  使用无菌水(RNase-free)稀释 RNA 样本,检测 260  nm  280  nm 吸光值,A260/280 应大于 1.8

B.  使用公式A260× 40 ×稀释倍数  = XXXXμg/mL 计算 RNA 浓度。

C.  使用琼脂糖凝胶电泳检测 RNA 完整性。

D.  建议:RNA 质量测定后,逆转录得到CDNA,建议用多个内参基因自行验证CDNA 质量;

推荐购买biotnt 的样本质量验证引物套装,可以在进行QPCR 之前对样本进行验证(包含内参引物,如human beta actin GAPDH,  18sRNA)

E.  基因组DNA污染控制

每个Array板块上的GDC(Genomic  DNA  Control)反应孔专为检测每个样品进行qPCR反应时可能存在的基因组DNA污染而设置。如果该反应孔的CT值小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。因此,必须从RNA样品中去除基因组和其他全部残余污染物。建议采用Qiagen 柱式抽提过程中加入DNAse去除基因组污染。

建议在进行PCR array 之前购买BioTNT 样本质量验证引物套装或者单独的GDC 引物进行基因组DNA 污染控制的质量验证;验证结果CT 值如果小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。

 

8. 如何进行样本的调平?

回答:进行PCR array之前,对样本需要进行调平。具体调平方式为:  

1.     RNA 含量调平:实验样本的RNA 尽量调到同一水平;加入RNA free的水,调整RNA浓度;

2.   调平后的样本:通过内参引物进行验证,根据CT 值,进行二次调平。

 

9. BioTNT PCR array定制费用如何?

回答:目前BioTNT PCR array 提供您的定制,仅比预制产品增加了400/板的定制费用。您可以把您要检测的指标给我们,然后把您的仪器型号,以及sample 数量,重复数量提供给我们,我们为您设置相应的PCR array 形式,并核算相应的费用给您。

BioTNT PCR array的定制,方式灵活,1 plate起订。

详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击定制服务

 

10.        如果我没有QPCR 仪器,BioTNT 能够提供什么服务?

回答:您可以选择BioTNT PCR array service

     详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击service

 

 

 

产品咨询:sales@biotnt.com    BioTNT订阅号:
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产品搜索说明:
 
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2. 由于某些产品的英文名较多,可更换关键词搜索;
3. 当进行品名搜索时,切勿将品名和种类同时输入,否则就有可能搜索不到产品(例如:FAST Frame for Chip Kits - 4 Slide frame 生物芯片,将有可能搜索不到产品或者过多的产品);
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